1、獸用抗病毒藥物缺乏
獸用抗病毒西藥禁用，抗病毒中藥療效不明顯，病毒性疾病治療藥物出現空白，市場上中藥制劑隨意復方抗病毒西藥的違法現象竟然成為一大“邁點”。
2、國標獸藥推廣阻力很大
國標獸藥應用對臨床獸醫水平有較高的要求；臨床濫用藥現象嚴重，耐藥菌毒株不斷增多，國標單方藥療效欠佳，聯合用藥成本又增加。市場所謂“一針治百病”的違法、違規大處方獸藥仍占市場主流。
3、獸藥市場混亂，不公平競爭現象嚴重
各個獸藥生產廠家 “八仙過海，各顯神通”，比誰家的價格低，比誰家的商品名起得好，比誰家的復方獨特，比誰家的拌料量大，比誰家寫的適應證更有煽動性等等，違法違規現象屢見不鮮。
4、 新獸藥開發壓力很大
市場上的“新獸藥”多為擁有一個很有吸引力的商品名、華美的包裝及沒有科學依據的大處方，許多生產企業的產品研發也就是在這方面下功夫，大多數企業不愿意在真正的新獸藥開發上投資；質量監控對復方獸藥開發有一定的限制。新獸藥研制周期長，申報手續多等，給新獸藥開發帶來一定的壓力。
5、 獸藥產業變幻莫測
現有企業面臨轉變，有經銷商轉變為大的養殖場養殖集團，但是這樣的養殖場進攻風險大，面臨賒賬甚至欠款問題，成功率也比較低，所以獸藥產業步入低谷。
