1、鏡檢。無菌操作采取壞死肝組織，用兩張玻片作肝組織壓片，火焰固定，革蘭氏染色后鏡檢，可見革蘭氏染色陽性、有內生芽孢的桿菌。

2、細菌分離培養。無菌操作采集病死鴨肝臟和脾臟，劃線接種于普通營養瓊脂培養基和色氨酸磷瓊脂培養基，普通營養瓊脂培養基和置于37℃下24小時后觀察，可見白色、圓形、隆起、半透明的菌落，經涂片、染色和鏡檢，可見菌體形態與壓片相同。

3、生化物性。挑選典型菌落接種于糖發酵管發酵葡萄糖、蔗糖、甘露糖、困糖、麥芽糖和棉子糖，產酸產氣；不發酵乳糖、鼠李糖、山梨醇。不液化明膠，不產生吲哚和亞硝酸鹽。

4、藥敏試驗。該菌對鏈霉素高敏，對恩諾沙星、環丙沙星中敏，對青霉素、新諾明不敏感。

根據臨床癥狀、病理變化、實驗室檢查，診斷該病是由魏氏梭菌引起的壞死性腸炎。