1、藍眼病在商品豬首發于“產仔室”而且表現中樞神經癥狀和高的死亡率，同時一些斷奶仔豬和育肥豬發生角膜混濁，死亡率急劇上升，然后短時間內降低。因豬的年齡不同，臨床表現不一樣。

2、2-15日齡小仔豬最易感染，臨床癥狀驟然出現，健康仔豬突然側臥虛脫或出現神經癥狀，開始發熱、被毛粗亂、弓背，有時伴有便秘和腹瀉，然后出現運動失調、虛弱強直（主要見于后肢）、肌肉震顫、姿勢異常（如犬坐樣）等神經癥狀。一些病豬有角膜炎，并伴有眼瞼水腫和流淚，眼瞼緊閉，粘有分泌物，有1-10%感染豬呈單側或雙側性角膜混濁。最早發病的仔豬在48小時內死亡，后出現的病例在出現癥狀4-6天后才死亡。

3、藍眼病暴發期，仔豬的感染率為20-65%，感染仔豬的發病率為20-50%，死亡率達87-90%，受感染的母豬表現正常，或在仔豬出現癥狀前1-2天有中度厭食現象。

4、大于30日齡的豬表現中度和暫時性臨床癥狀，包括厭食、發熱、打噴嚏、咳嗽等，但神經癥狀不常見，且不明顯。如有則表現為倦怠、運動失調、轉圈，呈單側或雙側性角膜混濁和結膜炎，可持續一個月而無其它癥狀。30日齡以上的豬感染率僅為1-4%，且死亡率低。

5、后備母豬和其它成年豬偶見角膜混濁，懷孕母豬的返情率達20%，并可持續4個月。

6、公豬單側性睪丸增大，14-40%的公豬繁殖力降低，睪丸萎縮并伴有副睪硬化。