1、病毒侵入感染禽舍通常的遮擋較好，不通光，潮濕的環境滋養著大量的真菌，還有沙門氏桿菌、大腸桿菌、禽霍亂、家禽鸚鵡病等等都會使家禽肺部感染。真菌性感染主要是曲霉菌病，病原為煙曲霉菌和黃曲霉菌為主，主要侵害肺和氣囊，多見于雛禽。大腸桿菌感染易由支原體禽病引發并大多數情況下與沙門氏桿菌交叉混合感染，繼而侵入肺部；引發肺炎。沙門氏桿菌病又稱白痢，多發于雛雞，一旦發病，死亡率相當高。
2、環境原因規模化養殖禽舍一般都是封閉的，特別是雞舍，從幼雞到舍到養肥出售，無法進行階段性的完整清掃雞舍，大量糞便和殘余飼料的長期堆積造成圈舍內充斥著大量有害氣體；加上雞舍環境的污穢潮濕，通風不良，空氣的流動性較差，換氣不暢，造成空氣不潔，大量的家禽擁擠在一起，很容易造成呼吸道疾病，進而引發肺炎。有的禽舍遮擋保溫條件差，季節交變時刻或是氣候溫度驟變，家禽容易感冒。特別是羽毛未豐滿的時候或是冬秋突然降溫的季節，更易出現感冒狀況。
3、異物入侵這主要發生在鴨、鵝習水性家禽。當鴨、鵝群放牧的時候，若是遇到狂風暴雨及臺風的襲擊，鴨、鵝的鼻孔位于喙的背面，喙扁而平、面積大，很容易把密集雨滴吸入，或雨水隨羽毛流入鼻孔而被吸入肺，引發異物性肺炎或壞疽性肺炎。
