抗菌藥物之間以及抗菌藥與其他藥物相混合時，有時能產生配伍禁忌，應設法避免。用時應注意以下幾點：

1.四環素類最好單獨應用，因與多種抗菌藥物（如青霉素、磺胺藥、氯霉素、多粘菌素、紅霉素、新生霉素、多粘菌素B、E等）有配合禁忌。此外，亦不宜與氫化可的松、碳酸氫鈉、乳酸鈉、氨茶堿、氯化鈣等配伍。其他最好單用的抗菌藥有氯霉素、紅霉素、卡那霉素、萬古霉素、氨芐青霉素、新青霉素Ⅰ、二性霉素B、磺胺藥等。

2.青霉素G鉀鹽不宜與四環素、磺胺藥、卡那霉素、慶大霉素、紅霉素、多粘菌素E、萬古霉素、二性霉素B并用，亦不宜與氫化考的松、氯丙嗪、碳酸氫鈉、維生素C等相混合。

3．氫化可的松與多種抗菌藥有配伍禁忌。