1、雞群潛在的免疫抑制病也是加重呼吸道系統病的一個很重要的因素，如傳貧，馬立克氏病，淋巴白血病，呼腸弧病毒，網狀內皮組織增生病，IBD等，IBD本身就是免疫器官，受到侵害或由于過早使用強毒侏疫苗，破壞了法氏囊的免疫功能后，使其他免疫受到了抑制，都會造成呼吸系統疾病的發病率
2、還有就是我們在免疫后(活疫苗)，免疫就是模擬疾病的輕微的發病過程，所以會帶來或高或低的免疫反應。如商品肉雞一般在14天時接種IBD免疫時免疫過后會出現輕微的IBD癥狀和呼吸道癥狀，蛋雞在小日齡過早的接種傳喉疫苗后，就會引發傳喉的發生，所以疫苗本身就可以增加呼吸道病的病情。
3、雛雞的早期免疫途徑，也就是免疫受體就是呼吸道的上皮細胞，要是感染支原體后呼吸道的完整性就會受到破壞，首免的免疫效果會很不理想，基礎免疫效價本來就很低，所以抵抗不了病毒的入侵，會造成免疫失敗，然后會出現多種疾病的混感發生，所稱的呼吸道綜合癥。
4、支原體病主要侵害雞的呼吸道上皮黏膜細胞，受到破壞后其它病原如，ND，AI病毒等展可以直接進入呼吸道繁殖，當機體抵抗能力下降時(抗體效價接近臨界值后)雞就可以發病。其次由支原體破壞了破壞了呼吸道的上皮黏膜組織后，在環境中的大腸桿菌會迅速繁殖，經過氣囊和血液逐漸發展到全身，造成大腸桿菌的爆發。所以說一旦發生了支原體同時就會繼發大腸桿菌病。
