綠頭野鴨的消化器官包括：喙、口腔、舌、咽、食道、嗉囊、腺胃、肌胃、腸（小腸、盲腸、大腸）和泄殖腔等，缺少唇、齒、軟愕和結(jié)腸。消化器官主要用于采食、消化食物、吸收營養(yǎng)以及排泄廢物（圖4）。

喙（嘴）：綠頭野鴨喙扁平，邊緣粗糙，有許多細(xì)小缺溝，有助于攝食細(xì)小的飼料。攝食水中飼料后將泥水等從喙兩側(cè)排出。

口腔：鴨口腔內(nèi)沒有牙齒，依靠喙將某些飼料撕碎。唾液腺不發(fā)達(dá)，唾液內(nèi)含少量的淀粉酶。飼料在口腔內(nèi)被唾液稍微浸濕即進(jìn)入食道。

食道：食道位于氣管的右側(cè)，食道寬大而富有彈性。綠頭野鴨沒有真正的嗉囊，僅在食管頸部形成一紡錘形囊貯存飼料，并分泌粘液以濕潤和軟化飼料。

胃：胃分前后兩部。前部是腺胃，后部是肌胃。肌胃發(fā)達(dá)，內(nèi)有一層堅硬的角質(zhì)膜，此角質(zhì)膜有保護(hù)作用，使胃壁在粉碎堅硬飼料時不致受損。肌胃通過肌肉收縮使其摩擦，能磨碎飼料，起到咀嚼作用。

小腸：是消化飼料、吸收營養(yǎng)物質(zhì)的主要部位。小腸分泌的腸液中含有淀粉酶、蛋白酶、脂肪酶，可將蛋白質(zhì)分解為氨基酸，淀粉分解為葡萄糖，脂肪分解為脂肪酸和甘油。

大腸：由一對盲腸和直腸所組成，大腸不分泌消化液。僅起到消化纖維素和吸收水分的作用，但對纖維分解程度有限，故綠頭野鴨對粗纖維的消化率較低。

泄殖腔：是消化、泌成和生殖三個系統(tǒng)的共同出口，肛門開口于體外。

肝臟：較大，位于腹腔前下部，分左右兩葉，左葉有一膽囊，分泌膽汁利于消化脂肪類飼料。

胰腺：位于十二指腸瓣內(nèi)，呈淡黃色，長形，分背腹兩葉。