雖然禽類的上呼吸道受多種微生物的持續攻擊，但并不是意味著經常發病。禽本身的天然和獲得性防御功能可有效的抵抗感染，抑制病原微生物的增殖或阻止其在組織中定植。呼吸道的黏膜纖毛系統可有效的清除病原微生物和顆粒物。

有些病毒性傳染病可引起呼吸道局部纖毛脫落和感染細胞溶解，進而引起細胞產物及其碎片的積聚，這為細菌繁殖及細菌接觸宿主細胞創造了有利條件，這是細菌性呼吸道傳染病的重要致病機理。

從雞的解剖結構可看出鼻腔對于呼吸道來說就是門戶，如果黏膜受損，為病原體敞開了大門，就會引起一系列的病變，所以說鼻炎是大腸桿菌的導火索；病毒、支原體、細菌、應激因素、環境不良都會影響呼吸道黏膜的完整性，使之排異能力下降，給病原體提供感染機會。在雞舍環境溫度高時，雞為了蒸發散熱就會用口呼吸，雞所呼入的氣體有3/4先進入氣囊，而氣囊又是溫暖而潮濕的環境，就很容易發生氣囊的病變。