無論是蛋雞還是肉雞，普遍存在一個“過料”的問題，使用治療腸毒的藥物有一定的效果，但是往往停藥即復發，嚴重影響生產性能和料肉比。其實“過料”的“元兇”就是小腸球蟲；“幫兇” 就是厭氧菌。小腸球蟲的發病原因：1、小腸球蟲的感染：由于小腸球蟲在腸粘膜上大量生長繁殖，導致腸粘膜增厚，嚴重脫落及出血等病變，幾乎使飼料不能消化吸收，同時，對水分的吸收也明顯減少，盡管雞大量飲水，也會引起脫水現象。這是引起蛋雞糞便稀薄、帶有未消化的飼料的原因之一。是產蛋率因飼料吸收不良出現下降的原因，也是蛋殼色澤變陳舊的因素之一。2、腸道內循環的變化：在小腸球蟲感染的過程中，小腸球蟲在腸粘膜細胞里快速裂殖生殖，因球蟲的大量增殖需要消耗宿主細胞的大量氧，導致小腸粘膜組織產生大量乳酸，使得雞腸道內PH值嚴重降低。由于腸道PH 值的改變，腸道菌群發生改變，有益菌減少，有害菌大量繁殖，特別是大腸桿菌、沙門氏菌、產氣莢膜桿菌等趁機大量繁殖，球蟲與有害菌相互協同，增強了致病性。腸道內容物PH值的下降，會使各種消化酶的消化能力下降，飼料消化不良，

另外，PH值的下降，會刺激腸道粘膜，使腸的蠕動加快加強、消化液排出增多，飼料通過消化道的時間縮短，消化時間減少，導致飼料消化不良。由于腸的蠕動加快加強，膽囊分泌的膽汁迅速從腸道排出，與沒消化的飼料混合在一起，形成該病的特征性糞便略帶淺黃色的。3、自體中毒：在發病過程中，大量的腸上皮細胞破裂，在細菌的作用下發生腐敗分解，以及蟲體死亡、崩解等產生大量有毒物質，被機體吸收后發生自體中毒。從而在臨床上出現產蛋下降，部分雞先興奮不安，后癱軟昏迷衰竭死亡的情況。臨床一些癥狀： 產蛋率升的很慢或到一定的產蛋率后就不升，一部分雞群雖然產蛋率超過90 %，過15--30天就出現猛然下滑。 糞便呈現拉稀較多，有的雞群并不拉稀，糞便相對很干燥的，但糞便很短、小、細；拉稀的雞群糞便主要表現消化不良，有的雞拉手掌大小的灰白色奶樣稀便，有的像一堆豆皮樣的糞便，內有很多沒消化的飼料；有的雞群就不出現肉樣或西紅柿樣的糞便，所以最易造成誤診。病雞出現采食減少、吃料慢、料槽有剩料，有閉眼但精神很好的雞只，這對診斷很重要。一般剖檢可見： 腸管肥厚、變粗、擴張，腸管中有凝固的血塊，小腸外觀呈現淡紅色或黃色； 被損害的十二指腸和小腸前段出現大量淡灰色斑點，排列成橫行，外觀呈階梯狀；有時腸壁上出現針頭大小的紅色圓形出血點，臨床常表現出小腸一段粗一段細，很明顯。腸道粘膜嚴重脫落，腸道內有一定量黃白色的滲出物，有的粘膜上有梯狀排列橫紋。很大部分的從小腸漿膜就看不到圓形的白色和紅色的壞死點的癥狀，但是個別有的病例還是可以看到的。臨床治療方法： 肉雞可以使用磺胺類藥物治療球蟲，蛋雞最好使用純中藥的藥物治療球蟲；厭氧菌可以使用甲硝唑或林可霉素治療。同時配合維生素K3和維生素A效果會更好。另外還應該加強環境管理與消毒。