溫和性禽流感又叫致病性禽流感、非高致病性禽流感和溫和型禽流感，它是指某些致病性低的禽流感病毒毒株（如N9N2亞型）感染家禽引起的以低死亡率和輕度的呼吸道感染或產蛋率下降等臨床癥候群，其本身并不一定造成禽群的大規模死亡。由于它們對家禽養殖和貿易的影響沒有高致病性禽流感嚴重，因此沒有被列入A類或B類疾病。但它感染后往往造成禽群的免疫力下降，對各種病原的抵抗力降低，常常易發生并發或繼發感染。

當這類毒株感染伴隨有其他病原感染時，死亡率變化范圍較廣（5%～97%），高死亡率主要出現在青年雞、產蛋雞或嚴重應激的雞，損傷主要發生在呼吸道、生殖道、腎或胰腺。因此低致病性禽流感對養禽業的危害也是很嚴重的。禽流感的流行特點慢性禽流感多發于野禽中，通常患病野禽只會顯現輕微癥狀，甚至根本觀察不到任何發病癥狀。各種日齡的家禽都可發生，但臨床主要多發現于蛋禽群，尤其蛋雞、蛋鴨。本病一年四季均可發生，但主要多發于秋冬季節，尤其是秋冬交界、冬春交界氣候變化大的時節。氣候多變，飼養管理不當，密度過大，通風不良，有害氣體過多損傷上呼吸道黏膜，都是低致病性禽流感發生的誘因，也極易造成細菌和病毒的多重感染，尤其是呼吸道病毒最易感染。慢性禽流感臨床癥狀雞初期表現體溫升高，精神沉郁，叫聲減小，縮頸，嗜睡，采食量減少或急驟下降，嗉囊空虛，排黃綠色稀便。呼吸困難，咳嗽，打噴嚏，張口呼吸。后期部分雞只有神經癥狀，表現頭頸向后仰，抽搐，運動失調，癱瘓等。產蛋雞感染后，蛋殼質量變差、畸形蛋增多，會出現軟殼蛋、無殼蛋、退色蛋等。2天～3天產蛋開始下降，7天～14天產蛋可下降到5%～10%，嚴重的雞可停止產蛋。持續1周～5周產蛋開始上升，但恢復不到原來的水平。一般經1個月～2個月逐漸恢復到90%～70%的水平。種雞還表現種蛋受精率下降20%-40%，并導致10%左右的死胚，苗雛弱雛率增加，10%～20%的雛雞在1周內出現死亡。慢性禽流感的臨床鑒別診斷雞慢性禽流感病毒所表現的臨床癥狀和病理變化與多種疫病相似，極易與非典型雞新城疫相混淆。兩者的主要區別為：慢性禽流感多發生于1月齡以上家禽，主要發生于成年產蛋雞群，也有15日齡肉雞發病的報告，死亡率不高；非典型雞新城疫可發生于任何日齡的雞群，主要發生于40日齡～60日齡、100日齡～120日齡和產蛋后期，這與其免疫狀態有關，且伴隨著較高的死亡率。后者對鴨群的感染臨床表現不明顯。慢性禽流感主要表現產蛋量的急劇下降，一般在7天～10天的時間內可以使產蛋率下降50%以上；非典型雞新城疫的發病相對比較溫和，產蛋下降30%左右。