豬繁殖與呼吸綜合癥病毒主要侵害豬體的巨噬細胞系統，特別是肺泡巨噬細胞，使感染豬的免疫力降低，引發免疫抑制。但許多研究證明PRRSV引起的免疫抑制是暫時性的，僅在肺中并局限于一定的水平。由PRRSV引發的豬的呼吸道病常伴發細菌感染是PRRSV感染的一大特征。由PRRSV引起的免疫損傷和在合并癥中各種病原微生物的關系在試驗中沒有得到復制，不同 PRRSV毒株在誘發機體產生免疫抑制方面的差別也沒有得到比較。所以在沒有實驗室證據前，應慎重看待PRRSV在誘發豬體產生免疫抑制方面的作用。