加強環境控制奶牛飼養場生產區應與生活區隔離，場內不得飼養貓、狗、豬、雞、鴨等動物，并禁止其他動物出入，努力消滅鼠蠅等傳播媒介；奶牛場及牛舍出入口處應設置消毒池，內置3%～5％來蘇爾溶液或20％石灰乳等有效消毒劑，每10天更換一次；牛舍內的一切用具每半月消毒一次，分娩處(室)在臨產牛生產前及分娩后各進行一次大消毒，牛場每年進行2次～4次大消毒。檢出疫情后，對病牛、陽性牛、可疑牛的牛床及其食槽等每天進行一次消毒，飼養工具使用后及時消毒，糞便等排泄物應單獨收集進行無害化處理，對運動場地要徹底清污并連續消毒3天～5天。奶牛場的金屬設施、設備采取火焰、熏蒸等方式消毒；飼槽、飼養工具、牛欄、天棚、舍內地面、墻壁、糞尿溝、分娩室等，可用2％燒堿、5％來蘇爾或氯制劑等消毒；運動場地清掃后用20％石灰乳消毒；飼養場的飼料、墊料采取深埋或發酵處理；糞便采取堆積密封發酵或深埋處理。對問題牛隔離飼養所有規模飼養場(戶)應建有隔離牛舍，隔離牛舍處在下風口，并與健康牛舍相隔50米以上。

對發現的“兩病”病牛或檢測陽性牛，在撲殺無害化處理前須在隔離牛舍內飼養。對發觀的疑似“兩病”病牛、檢測疑似“兩病”陽性牛，須在隔離牛舍內復檢。未建立隔離牛舍的奶牛場(戶)，對發現的“兩病”病牛、檢測陽性牛、可疑牛須就地隔離，分區集中飼養，及時撲殺無害化處理或進行復檢，并采取加強消毒、固定工具等措施，防止疫病傳播蔓延。無害化處理病牛對發現的“兩病”病牛或檢測陽性牛，要及時撲殺無害化處理。“兩病”病牛、檢測陽性牛撲殺無害化處理前生產的牛乳，“兩病”可疑牛隔離飼養期間生產的牛乳，均需經高溫等無害化處理。布魯氏菌病病牛及檢測陽性牛的胎兒、胎衣、排泄物均要深埋等無害化處理，防止人畜感染發病。凈化受污染牛群被確診為“兩病”病牛或檢出“兩病”陽性牛的牛群(場)為牛“兩病”污染群(場)，要全面實施“兩病”凈化工作。①污染牛群(場)的處理：對牛群進行反復監測，布魯氏菌病污染牛群(場)間隔兩個月檢測一次，結核病污染牛群（場)間隔3個月檢測一次，發現病牛、陽性牛及時撲殺，可疑牛及時隔離復檢。②假定健康牛群的處理：經撲殺病牛及陽性牛后的牛群為假定健康牛群。假定健康牛群的處理同污染牛群；凡連續兩次以上監測結果均為陰性者，可認為是健康牛群。③健康犢牛群的培育：設立犢牛培育舍，犢牛培育舍應遠離母牛群500米以上，假定健康母牛生下的母犢牛，設專人飼養管理，固定使用飼養工具。犢牛出生后用3%～5％來蘇爾溶液進行全身消毒，擦干后放入犢牛培育舍飼養。犢牛在犢牛培育舍飼養6個月后轉入生產群，在此期間分別于20日齡、100日齡～120日齡和6月齡連續檢測“兩病”三次，犢牛進培育室前，每次“兩病”檢測后及轉群后，犢牛培育室各進行一次消毒。沒有犢牛培育舍的奶牛飼養場(戶)，母牛所生的母犢牛，應離開母牛群單獨區域隔離飼養，并做好相應凈化工作。