影響孵化率的因素有很多，遺傳與種蛋只是眾多因素中的兩種，要想提高孵化率任何一種因素都不容忽視。

遺傳因素：不同品種或不同品系的孵化率不同;近交種蛋孵化率低，因為雞的致死基因可導致孵化末期的胚胎死亡;雜交種蛋孵化率高。種雞周齡，母雞初產期的蛋孵化率低;在30周齡~42周齡產的蛋孵化率最高;以后隨周齡增長而逐漸下降,約在45周齡后，孵化率降低2%~5%。母雞產蛋量，雞的產蛋量與孵化率呈正相關，即雞群產蛋量高其孵化率也高;影響產蛋量的因素也同樣影響孵化率。種雞營養，日糧中營養不全如缺乏維生素A，孵化初期死胚增多;缺乏維生素D，孵化后期胚胎死亡率高;缺乏B族維生素，蛋白稀薄，孵化中期死胚增加，弱雛增多。礦物元素鈣、磷、鋅、錳等缺乏，孵化率降低。種雞管理，雞舍溫度、通風及墊草的狀況不良，造成舍內衛生較差，種蛋受到污染，從而影響孵化率。種雞感染蛔蟲、雞白痢、雞支原體等病均影響孵化率。有些疾病如雞白痢、雞支原體病等，可以通過帶菌母雞經蛋傳染。尤應注意。

種蛋的原因:種蛋的品質，裂縫、污穢、畸形、太大、太小的蛋孵化效果不佳。種蛋的保存，短期保存種蛋對孵化率的影響不大，但保存期延長就會導致孵化率不斷下降。保存種蛋的溫度太低，相對濕度不足，通風不良，翻蛋不當，都影響孵化率。種蛋受凍、受振以及消毒不嚴，均可造成胚胎早期死亡增多，胚胎發育受阻，孵化率降低。