養鴨防病建立科學的疾病防御體系很重要，該如何建立這個體系呢？應該從以下幾個方面入手：

把好入口關：大門口嚴格標識“防疫重地，謝絕參觀”，設專人把守，嚴禁外來車輛和人員進場；進入生產區時必須洗手消毒并經消毒甬道(有消毒水池和紫外光)方可進入。

防止交叉感染：各舍飼養員禁止竄場、竄崗，以防交叉感染。場區環境應保持干凈無污，不要輕視野鳥對傳染病的傳播，嚴防其糞便污染飼料和運動場；堅持定期的全場和帶鴨消毒，發病期間要天天消毒；做好滅鼠和滅蚊蠅工作。病死鴨和解剖病料必須做無害化處理，不得任其污染環境，造成人為的傳播疾病。

疾病防治：獸醫對病死鴨要勤于解剖，病料應及時進行實驗室檢驗，依據藥敏試驗結果用藥防治。初期投藥后，獸醫仍應進行跟蹤治療，直到病愈為止。獸醫根據藥敏試驗、臨床用藥情況、發病日齡和季節，結合生產實踐，獲得本場的預防用藥程序。在選藥時，避免使用假冒偽劣獸藥而延誤病情，導致嚴重的經濟損失。

疫病監測：根據當地實際情況，制定疫病監測方案，肉鴨飼養場常規監測的疫病至少應包括：高致病性禽流感、鴨瘟、鴨病毒性肝炎。除上述疫病外，還應根據當地實際情況，選擇其它一些必要的疫病進行監測。