肉雞球蟲病發病癥狀，典型的病癥是糞便中有不消化的飼料，也就是常說的“過料”。最早的可發生在7-8日齡，糞便惡臭，有橘黃色糞便或胡蘿卜絲樣血便，多數水糞分離、冠髯及可視粘膜蒼白貧血、兩翅下垂、兩腳麻痹或痙攣性伸縮、抗體消瘦、嗉囊充滿液體。若無其他繼發病，死亡率多數很低，抗病力降低，但料肉比增加。肉雞上常見的球蟲病主要是小腸球蟲和盲腸球蟲。小腸球蟲多發于籠養和平養的肉雞，盲腸球蟲一般地養的較多發。

肉雞球蟲病主要是雞食入了被球蟲卵囊污染的飼料、飲水后，卵囊被胃內消化液溶解，子孢子游離出來寄生在雞的腸道上皮細胞內進行裂殖生殖時引起腸管反應和大量上皮細胞崩解，以致使腸管的分泌運動及吸收功能發生障礙。腸壁的炎性變化和血管破壞則使大量的液體和血液流入腸管內。這時病雞表現為消瘦、肌肉蒼白、貧血和排胡蘿卜樣血便等癥狀。同時上皮細胞崩解后所產生的有毒物質蓄積在腸管中引起機體中毒，表現為精神沉郁、昏迷、翅下垂。腸粘膜損傷后為病原微生物和腸道有毒物質侵入打開了門戶，導致各種繼發性感染。