通過建立生物安全體系，采取嚴格的隔離、消毒和防疫措施，降低和消除豬場內污染的病原微生物，減少或杜絕豬群的外源性繼發感染機會，從根本上減少和依賴用疫苗和藥物而實現預防和控制疫病的目的。

生物安全體系主要著眼于為畜禽生長提供一個舒適的生活環境，從而提高畜禽機體的抵抗力，同時盡可能地使畜禽遠離病原體的攻擊。

養殖場的選址要合理養殖場必須遠離生活區、交通主干線，遠離化工或生物制品廠。選擇在地勢高、供水便利的地方。這樣就可防止外來病原的侵襲。有的養殖場戶為了方便，租用別人已用過的舊養殖場，這樣會增加養殖的危險性。

養殖戶要進行科學的飼養管理有的養殖戶給予的飼料單一、營養不全，且房間通風不暢、飼養密度過大，這樣一來，不但養殖效益不高，而且不利于疫病控制，增加了疫病的危害性。養殖戶有的甚至用霉變飼料飼喂，造成動物應激，使體內條件性病原菌或外來病原菌有機可乘。養殖場必須使用全價飼料，防止飼料霉變，并且要定期驅蟲。

養殖場須制定衛生防疫措施一是防止閑雜人員及動物入場。二是對場內環境進行消毒，一般每年春秋各1次。畜舍內每周用消毒藥噴霧消毒1次。消毒藥品要交替使用，以免長期使用一種藥品病菌會產生耐藥性。常用的消毒藥品可用10%~20%石灰乳，5%來蘇兒，0.3%~0.5%的過氧乙酸、百毒殺等。三是對動物糞便及時清除，可進行發酵處理后歸田，對養禽場還必須注意經常通風。四是對病畜禽尸體及時清除，并對場地進行消毒，不可在養殖場內進行尸體解剖，以防疫病蔓延。

養殖豬雞一定要實行“全進全出”的飼養措施。每批畜禽在轉移調走之后，用3%燒堿水對雞舍全面消毒一次，然后用清水沖洗干凈，間隔5天~7天，再進另一批。對牛羊養殖，引種一定要首先了解種畜產地疫情狀況、種畜的健康狀況以及免疫狀況。注意種畜引入后至少需隔離一個月，確保健康后方可入群。

藥物控制預防為主，治療為輔，控制藥殘。

要堅持預防為主的原則，制定科學的用藥程序，搞好藥物預防、驅蟲等工作。有的畜禽傳染病只能早期預防，不能治療，要做到有計劃、有目的適時使用疫（菌）苗進行預防，及時搞好疫（菌）苗的免疫注射，搞好疫情監測。盡量避免動物發病用藥，確保畜禽及產品健康安全、無殘留。必要時可添加作用強、代謝快、毒副作用小、殘留最低的非人用藥品和添加劑，或以生物學制劑作為治病的藥品，控制畜禽疾病的發生發展。

要堅持治療為輔的原則需要治療時，在治療過程中，要做到合理用藥，科學用藥，對癥下藥，適度用藥，只能使用通過認證的獸藥和飼料廠生產的產品，避免產生藥物殘留和中毒等不良反應。盡量使用高效、低毒、無公害、無殘留的“綠色獸藥”，不得濫用。

獸醫指導規范用藥確有疾病發生時，治療用藥要在獸醫人員指導下規范使用，不得私自用藥。用藥必須有獸醫的處方，處方上的每種藥必須標明休藥期，飼養過程的用藥必須有詳細的記錄。

要了解獸藥的常識，要選擇成本低、效果好、副作用小的獸藥如生物制劑的疫（菌）苗等，選擇正規和信譽度較好的獸藥生產單位的產品，了解獸藥的有效成分、作用、用途和注意事項，認真掌握畜禽病情、病因，準確用藥。

要有用藥情況記錄要對免疫情況、用藥情況及飼養管理情況進行詳細登記，必須按照獸藥的使用對象、使用期限、使用劑量以及休藥期等規定嚴格使用獸藥。遵守用藥規定，及時停藥。必須填寫用藥登記，其內容至少包括用藥名稱、用藥方式、劑量、停藥日期，并將處方保留五年作證據。