肉仔雞自身的生理特點決定了其抵御各種應激反應和疾病的能力很脆弱。生產上任何一種應激反應或發生呼吸道等疾病都會進一步降低肉雞的抵抗力，此時環境中的其它病原微生物乘虛而入而引起雞群發病。臨床上易發生的應激反應主要有以下幾點：晝夜溫差大、天氣突變如短期高溫、低溫、刮風、下雨；免疫毒力較強的法氏囊活疫苗。

此外，多因素、多病因綜合感染也可以誘發肉仔雞呼吸道疾病。如H9亞型禽流感、支原體、大腸桿菌等。多種病原產生致病協同作用，并發大腸肝菌和支原體是引起雞群死亡率較高的主要原因。