雞沙門氏菌病主要分為急性敗血型、亞急性型、慢性型。急性敗血型常發生于四周以內的雛雞。死前無臨床癥狀，突發性死亡。病程略長的可見到精神萎糜、不吃不喝，病后兩三天死亡。亞急性型見于四周以后育成雞和成年產蛋雞。以開產前后死亡最多。這時可見死亡率突增，可持續數周。有的拉稀，也有的無特殊癥狀而突然死亡。僅腹部膨大較明顯，有的雞冠發紫，死后雞冠多蒼白。慢性型見于成年雞。多數體重特別大，腹部膨大，停止產卵，死亡突然；少數表現瘦弱、拉稀、精神沉郁。這三種類型均很少見到拉白痢癥狀。

剖檢后雞胚在第5日照蛋可見到死亡的血胚增加很多，打開后見到血絲粘連在蛋殼上，同時發育遲緩的雞胚比例增多。在第18天照蛋，可見死胚增加，并出現有臭蛋，發育比同期正常雞胚慢1～2天。打開后雞胚表面多呈粉紅色充血，尿囊液混濁粘稠，有的頭部腫脹。未吸收完的卵黃囊大，且呈現綠色，雞胚腹腔內的腸道中有少量深綠色糞便。病雞胚比正常雞胚晚24～48小時破殼，弱雛無力啄破蛋殼，或啄破部分蛋殼后死于殼內。已出殼的弱雛身上粘滿蛋殼，不易剝落。部分弱雛臍部發育不好且與蛋殼粘連，也有的腹部膨大。血蛋與毛蛋所占比例增加，毛蛋多于血蛋。雛雞急性敗血型內臟多無明顯變化，卵黃吸收不良，殘留卵黃囊大，呈現綠色，有些雛雞患有臍炎；亞急性型卵黃吸收不全，肝臟腫大，有的紫紅色，有的土黃色，肝表面有點狀或條紋出血；脾臟比正常腫大2～3倍，表面有點狀出血；腎臟腫大，有點狀出血；胸肌有出血點；心包內有黃色漿液性滲出物，血凝不良；十二指腸壁增厚。成雞急性型（溶血型） 死亡突然，且許多是肥胖雞，腹腔內各臟器可見因破裂而出血。其中以肝破裂最多。也有的出血發生在皮下或肌內，血液不凝固，稀薄如水狀存留于腹腔內，肝臟腫大，卵巢多無變化，輸卵管中有待產出的卵；亞急性型（肝破裂型） 肝臟腫大，黑紅色，無白點，有3～5厘米長的不規則破裂口，有的在肝包膜下形成血塊。卵泡少，有的變性、萎縮，或在輸卵管中有已成型的卵；慢性型（腹膜炎型） 腹大，腸胃與輸卵管粘連在一起，可見到落入腹腔中已干化的卵黃，外面被干酪樣物質粘連，有的形成團塊，卵巢變性、萎縮，腸粘膜壞死，脫落。常見輸卵管中停留多個已變性的卵，腹膜增厚、混濁，有的包住卵黃和小腸。