本病一年四季均可發(fā)生，主要發(fā)生在秋冬季節(jié)。肉雞多發(fā)。其發(fā)病過程一般分三個階段。

第一階段：由于雞舍消毒不徹底、空棚時間短、不同日齡混養(yǎng)、或苗雞質(zhì)量差等原因而導致雞舍內(nèi)存在著大量的敗毒支原體、大腸桿菌、各種病毒等感染源，這時在外部應激（如接種疫苗，天氣突變等）情況下可最先誘發(fā)慢呼?。–RD）。一般發(fā)病日齡在第一次免疫接種后二天左右。表現(xiàn)為輕微咳嗽，打噴嚏和呼嚕音，采食影響不太，死亡少，解剖有輕微的氣囊炎。

第二階段：由于第一階段的慢呼治療不及時或不重視治療而使雞的抵抗力下降，同時隨著日齡增長，飼養(yǎng)環(huán)境變差，管理不好而并發(fā)大腸桿菌病。表現(xiàn)為慢呼大腸桿菌綜合癥（CCRD），氣囊渾濁，咳嗽，噴嚏和呼吸羅音，患病嚴重的有包肝、包心等癥狀，死亡增加。很多情況下，支原體病和大腸桿菌病往往同時發(fā)生，也就是說第一、第二階段往往同時發(fā)生。

第三階段：雞群發(fā)生慢呼大腸桿菌綜合癥的同時，隨著雞群日齡的增長，飼養(yǎng)環(huán)境也越來越惡劣；飼養(yǎng)管理難度的增加；環(huán)境中各種病毒野毒株的大量存在和繁殖；免疫抑制病的發(fā)生；免疫效果不佳導致的非典型病毒病的發(fā)生，如果這些致病因素中的一種或多種并發(fā)就可以形成慢呼、大腸桿菌、新城疫（或傳支、感冒等病毒病）混合感染的呼吸道綜合癥（MRD）。表現(xiàn)為死亡增加，病情加重，帶來較大損失。在實際發(fā)病時，發(fā)病的過程可能三個階段不會分的很明顯，有可能直接發(fā)生第二階段或第三階段，這就要求在診斷時根據(jù)實際發(fā)病情況具體分析，做出正確的判斷，合理的用藥。