1.弱毒疫苗
對微生物的自然強毒通過物理、化學方法處理和生物的連續繼代，使其對原宿主動物喪失致病力或只引起輕微的亞臨床反應，但仍保存良好的免疫原性的毒株或從自然界篩選的自然弱毒株，制備的疫苗。弱毒活疫苗的優點是免疫效果好，免疫力堅強，免疫期長，對種母代接種可使仔代獲得被動免疫。缺點是存在散毒和造成新疫源的問題。
2.滅活疫苗
又稱死苗，是利用物理或化學的方法處理微生物，使其喪失感染性或毒性而保持有良好的免疫原性，而制成的疫苗。滅活疫苗的優點是安全，不返祖，不返強，便于儲存運輸，對母源抗體的干擾作用不敏感，易制成聯苗和多價苗。缺點是不易產生局部粘膜免疫，引起細胞介導免疫能力較弱，用量大成本高，免疫途徑必須注射，需免疫佐劑來增強免疫應答，產生保護力慢，2—3周后才能刺激機體產生免疫保護力。
3.代謝產物疫苗
用細菌的代謝產物如毒素、酶等制成的疫苗，如破傷風毒素、白喉毒素和肉毒素等經福爾馬林處理后成為毒素，類毒素是廣泛應用的代謝產物疫苗。
4.亞單位疫苗
用微生物經物理化學方法處理，去除其無效物質，提取其有效抗原部分(如細菌莢膜、鞭毛，病毒衣殼蛋白等)，制備的疫苗(如豬大腸桿菌菌毛疫苗)。
5.活載體疫苗
應用動物病毒弱毒或無毒株如痘苗病毒、瘡疹病毒、腺病毒等作為載體，插入外源免疫抗原基因構建重組活病毒載體，轉染病毒細胞而制備的疫苗。
6.基因缺失苗
應用基因操作，將病原細胞或病毒中與致病性有關物質的基因序列除去或失活，使之成為無毒株或弱毒株，但仍保持免疫原性。用這種無毒株或弱毒株作成的疫苗為基因缺失苗。
7.單價疫苗
利用同一種微生物菌(毒)株或一種微生物中的單一血清型菌(毒)株的增殖培養物所制備的疫苗稱為單價疫苗。單價苗對相應的單一血清型微生物所致的疾病有良好的免疫保護效能。
8.多價疫苗
指同一種微生物中若干血清型菌(毒)株的增殖培養物制備的疫苗。多價疫苗能使免疫動物獲得完全的保護。
9.多聯苗
指利用不同微生物增殖培養物，根據病性特點，按免疫學原理和方法，組配而成。接種動物后，能產生對相應疾病的免疫保護，可以達到一針防多病的目的。
