與種雞有關的因素
1.遺傳因素：種雞的遺傳結構與孵化率有關，雞的品系、家系不同，其孵化率有一定差異;近交時孵化率下降，雜交時孵化率提高。
2.種雞年齡：母雞剛開產時孵化率低，孵出的雛雞也弱小。母雞在8~13月齡時產的蛋，孵化率最高，而后隨年齡增長種蛋的孵化率逐漸下降。產蛋量與孵化率呈正比例，雞群產蛋量高時，孵化率也高，影響產蛋量的因素也影響孵化率。
3.種雞的營養：種雞飼料中如缺乏維生素A，則孵出的雛雞或瞎眼或有眼疾；缺乏核黃素，孵出的雛雞一出殼就顯現出足趾卷曲麻痹癥；缺鋅時，孵出的雛雞絨毛發育不良。
4.種雞健康狀況：種雞感染蛔蟲病、雞白痢、雞霉形體病等均影響孵化率，有些疾病如白痢、霉形體病等，又可經蛋傳播，尤應注意。
與種蛋有關的因素
1.種蛋保存時間：種蛋保存超過7天，或保存期間環境相對濕度偏小，都會引起殘雛增多。
2.種蛋形態構造：蛋重、蛋形、蛋殼質量等均與孵化率有關。過大的蛋孵化前期胚胎感溫和后期散溫不良，孵化率較低；蛋殼薄時不僅易碎，蛋內水分蒸發也過快，破壞正常的物質代謝，孵化率也低。
3.種蛋污染情況：用窩外蛋、臟蛋孵化，種蛋內存在病原體；種蛋或孵化機具消毒不嚴；孵化室衛生狀況不良或臭蛋在機內爆裂，都會使雞胚感染病原體，而在孵出時出現較多的病、弱雛與死雛。
與環境有關的因素
1.氣溫：夏季高溫時，種蛋保存條件差，蛋白稀薄，孵化率低；冬季氣溫低時，如種蛋受凍，則孵化率大為降低。
2.海拔高度：海拔愈高，氣壓愈低，空氣含氧量愈少，因而孵化時間長，孵化率也低。海拔超過1000米的地區，應選孵化期短的品系或采取往孵化機內輸氧的措施，以提高孵化率。
與孵化條件有關的因素
1.溫度發生偏差：孵化機不良，孵化室與出雛室通風或環境控制不當，都會造成孵化溫度發生偏差。若機內氣流不暢，形成一些熱點與涼點，就會使胚胎產生某些畸形，如孵出小而濕的雛，臍部未閉合、交叉喙、絨毛粗短、缺眼、凸腦雛等。
2.濕度控制不當：當孵化機內相對濕度過大時，就會出現一些雛體粘有蛋白或者大而軟，有的膝關節發紅。這是因機內濕度大，蛋內水分未能很好地向外蒸發所導致。
3.轉蛋不當：如在孵化的前兩周，未能按時轉蛋或轉蛋次數、角度不夠，會發現雛與內殼膜粘連，造成殘翅或其他畸形。
