1.飼料因素 2.管理因素 3疾病 三個因素
飼料因素
養殖戶使用了劣質飼料，除了營養不均衡和吸收率差外，其中的粗纖維含量可能也會超標。也有的因為添加了劣質原料，破壞了腸道內環境，損傷腸粘膜導致發病
肉雞飲用了污濁的水源，會破壞雞腸道的內環境，進而發生細菌性或功能性腹瀉。
在肉雞生長的不同時期，需要更換不同的飼料。而在更換飼料時過急、過快，造成飼料應激，就會引起雞的腸粘膜損傷，出現應激性腹瀉。
管理因素
環境衛生差，消毒沒做好，墊料潮濕，都很容易誘發腸道疾病。
疾病因素
腸道菌群失調
肉雞腸道菌群失調，臨床上主要表現為泡沫盲腸糞便、橙色糞便和大灘盲腸糞便；雞只可能存在“勾料”（將顆粒飼料甩出料盤）、“料糞”（糞便中出現未被消化的飼料）、飲水量增加。發生菌群失調時，肉雞生產性能或不受影響，或使采食量減少，進而影響生長；腳病較常見。使用抗生素藥物后，有時稀便可恢復正常，但在以后的整個生長期內仍然易感，不能形成永久免疫力，病因不除，仍會復發。
病毒性腸炎
病毒性腸炎，多與輪狀病毒和呼腸孤病毒有關。
球蟲病
在肉雞的整個養殖過程中，球蟲病一直是最普遍的影響腸道健康和生長效率的重要疾病之一，而感染球蟲后所引發的腸道病原菌感染，也是引發腸道疾病的重要原因。
壞死性腸炎
引起壞死性腸炎的因素很多，但產氣莢膜梭狀芽孢桿菌是導致壞死性腸炎的一種普遍存在的厭氧性微生物。當肉雞感染亞臨床型球蟲病，飼料中淀粉和蛋白質的含量過高，使用部分小麥、大麥和燕麥等代替玉米作為能量飼料等情況下，產氣莢膜梭狀芽孢桿菌能在腸道中繁殖，產生毒性較強、肉雞敏感的 毒素而致病。
霉菌毒素蓄積性中毒
霉菌毒素正在逐步加重對我國肉雞的威脅。霉菌的污染，一般多見飼料、環境的污染。飼料污染最常見的是玉米的污染，其次是豆粕、雜粕的污染，然后是食槽內的污染和成品料的污染。
霉菌及其毒素的污染，對雞的各個系統各個組織都能造成損害，尤其是消化系統。如肌胃潰爛、腺胃腫大、腸粘膜脫落、腸道菌群失調等；臨床表現就是拉稀、拉不消化飼料糞便。我國養雞行業中流行的腺胃炎、肌胃腺胃炎，很大程度上都是由霉菌及其毒素引起的。但是，由于飼料霉變因素無法徹底排除，因而商品肉雞要經常面臨腸道不健康、消化系統功能不全的現狀。
