雞種蛋在整個孵化期中，都要認真操作管理，但是根據胚胎發育的特點，有兩個關鍵時期，1日胚齡~7日胚齡和18日胚齡~21日胚齡。在孵化操作中，盡可能地創造適合這兩個時期胚胎發育的孵化條件，即抓住了提高孵化率和雛禽質量的主要矛盾。一般是前期注意保溫，后期重視通風。

1日胚齡~7日胚齡為了提高孵化溫度，盡快縮短達到適宜孵化溫度的時間，采取以下措施：

種蛋入孵前預熱，既利雞胚的蘇醒，恢復活力，又可減少孵化器中溫度下降，縮短升溫時間。

孵化1天~5天，孵化器進氣孔全部關閉。

用福爾馬林和高錳酸鉀消毒孵化器里種蛋時，應在蛋殼表面凝水干燥后進行，并避開24小時~96小時胚齡的胚蛋。

5日胚齡前不照蛋，以免孵化器及蛋表溫度劇烈下降。整批照蛋應在5日胚齡以后進行。另外，應剔除破蛋。

提高孵化室的環境溫度。

要避免長時間停電。萬一遇到停電，除提高孵化室溫度外，還可在水盤中加熱水。

18日胚齡~21日胚齡雞胚18日胚齡~19日胚齡是胚胎從尿囊絨毛膜呼吸過渡到肺呼吸時期，需氧量劇增，胚胎自溫很高，而且隨著啄殼和出雛，殼內病原微生物在孵化器中迅速傳播，此期的通過換氣要充分。為解決供氧和散熱問題，應采取以下措施。

避開在18日胚齡移盤到出雛盤。可提前在17日胚齡，或延至19日胚齡時進行移盤。

啄殼、出雛時提高濕度，同時降低溫度。一方面是防止啄破蛋殼時，蛋內水分蒸發加快，不利破殼出雛；另一方面可防止雛禽脫水，特別是出雛持續時間長時，提高濕度更為重要。在提高濕度的同時應降低出雛器的孵化溫度，避免同時高溫高濕。19日胚齡~21日胚齡時，出雛器溫度一般不得超過37℃~37.5℃。出雛期間相對濕度提高到70%~75%左右。

注意通風換氣，必要時可加大通風量。

保證正常供電，此時即使短時間停電，對孵化效果的影響也是不小的，萬一停電的應急措施是：打開機門，進行上下倒盤，并用體溫表測蛋溫。此時，門表溫度計所示溫度絕不能代表出雛器里的溫度。

揀雛時間的選擇，一般在60%~70%雛禽出殼，絨毛已干時，第一次揀雛。在此之前僅揀去空蛋殼。出雛后，將未出雛胚蛋集中移至出雛器頂部，以便出雛。最后再揀1次雛，并掃盤。

觀察窗的遮光。雛雞有趨光性，已出殼的雛雞將擁擠到出雛盤前部。不利其他胚蛋出殼。所以觀察窗應遮光，使出殼雛雞保持安靜。

防止雛雞脫水。雛雞脫水嚴重影響成活率，而且是不可逆轉的，所以雛雞不要長時間呆在出雛器里和放在雛雞處理室里，雛雞不可能同一時刻出齊，即使較整齊，最早出的和最晚出的時間也相差32小時左右，再加上分級、打針、鑒別等出雛后的一系列工作，時間就更長。因此從出雛到送至飼養者手中，早出殼者，可能已近48小時，所以應及時送至育雛室或送交用戶。