微生物發(fā)酵飼料的作用主要體現(xiàn)在兩個(gè)方面，一是利用廉價(jià)的農(nóng)業(yè)和輕工副產(chǎn)物生產(chǎn)高質(zhì)量的飼料蛋白原料，二是獲得高活性的有益微生物。這些微生物制品的應(yīng)用，一方面可以提高飼料的轉(zhuǎn)化率,促進(jìn)畜禽生長(zhǎng);另一方面可以調(diào)節(jié)動(dòng)物的微生態(tài)平衡,提高動(dòng)物的健康水平。還有一些活菌劑可以用于治療動(dòng)物疾病。在水產(chǎn)動(dòng)物養(yǎng)殖中推廣應(yīng)用微生物發(fā)酵飼料，可以減少抗菌素的使用，有利于生產(chǎn)安全食品，提高產(chǎn)品出口的競(jìng)爭(zhēng)力。

補(bǔ)充有益菌，調(diào)節(jié)動(dòng)物的微生態(tài)平衡

健康動(dòng)物腸道內(nèi)生長(zhǎng)著各種各樣的微生物群落，各種微生物群落之間相互依存、相互制約，構(gòu)成畜禽腸道內(nèi)微生態(tài)系統(tǒng)的平衡，建立一個(gè)正常且平衡良好的腸道微生物區(qū)系對(duì)抵御病原性微生物感染具有十分重要的意義。由于微生物之間存在著相互作用，某一生態(tài)系統(tǒng)中現(xiàn)存的微生物會(huì)阻止新的有機(jī)體在這一部位的入侵，有益菌通過競(jìng)爭(zhēng)性抑制作用阻止有害微生物在腸粘膜附著與繁殖。因此對(duì)那些菌群形成遲緩或有障礙的動(dòng)物服用微生物飼料有著十分重要的意義。而對(duì)于成年動(dòng)物由于許多微生物只能在腸道內(nèi)存活相當(dāng)一段時(shí)間，必須連續(xù)服用活菌制劑才能保持某一微生物在腸道內(nèi)的定植。

化學(xué)屏障作用

通過有益微生物如乳酸菌類產(chǎn)生的有機(jī)酸(乳酸、丙酸、乙酸)使消化道內(nèi)pH值降低，抑制其他病原微生物生長(zhǎng)，環(huán)境pH值為4時(shí)大腸桿菌和沙門氏菌不能增殖，起到了維持腸道菌群平衡促生長(zhǎng)的作用，同時(shí)消化道內(nèi)的酸性環(huán)境促進(jìn)了礦物質(zhì)元素鈣、磷、鐵以及維生素D的吸收和利用。

產(chǎn)生有益代謝物，抑制和殺死有害菌

有益微生物可產(chǎn)生肽細(xì)菌素、酶類及少量無機(jī)物，可以抑制有害菌的生長(zhǎng)或阻止有害菌毒素在上皮細(xì)胞的粘附和侵入。如乳酸菌和鏈球菌產(chǎn)生的乳酸鏈球菌肽能抑制沙門氏菌、志賀氏菌、綠膿桿菌和大腸桿菌的生長(zhǎng);嗜乳酸桿菌和保加利亞乳桿菌可以產(chǎn)生少量過氧化氫抑制革蘭氏陰性病原菌的生長(zhǎng);乳酸桿菌和雙歧桿菌產(chǎn)生的胞外糖苷酶可以阻止細(xì)菌毒素的入侵。

具有營(yíng)養(yǎng)作用，促進(jìn)動(dòng)物生長(zhǎng)

微生物發(fā)酵飼料中的有益菌本身即為一種高蛋白物質(zhì)，同時(shí)在動(dòng)物腸道內(nèi)代謝可產(chǎn)生多種有助于動(dòng)物營(yíng)養(yǎng)消化的有益因，從而促進(jìn)水產(chǎn)動(dòng)物的生長(zhǎng)發(fā)育和增重.如芽孢桿菌能分泌多種消化酶(蛋白酶、淀粉酶、脂肪酶等)促進(jìn)營(yíng)養(yǎng)物質(zhì)的消化與吸收;酵母菌可以產(chǎn)生氨基酸、多種維生素(K、C、B1、B2、泛酸、煙酸、生物素、肌醇和葉酸等)供動(dòng)物體利用，酵母菌還可以促進(jìn)植酸酶的產(chǎn)生，提高對(duì)磷的利用率。

防止有害物質(zhì)的產(chǎn)生。

微生物發(fā)酵飼料促進(jìn)營(yíng)物質(zhì)的消化吸收，減少了氨和其他腐敗物質(zhì)的產(chǎn)生。研究表明：飼喂微生物發(fā)酵飼料可減少內(nèi)容物、糞便、門靜脈中氨的含量以及腸道中甲酚、吲哚、3-甲基吲哚等腐敗物質(zhì)的含量，減少糞便的臭味，凈化環(huán)境。

提高機(jī)體免疫功能

發(fā)酵飼料中的有益微生物可以作為一種非特異免疫調(diào)節(jié)因子，通過細(xì)菌本身或細(xì)胞壁成分刺激并激活宿主免疫細(xì)胞，促進(jìn)吞噬細(xì)胞活力或作為佐劑發(fā)揮作用。有益微生物還可以發(fā)揮特異性免疫功能，增強(qiáng)動(dòng)物體內(nèi)B細(xì)胞產(chǎn)生抗體的能力。直接飼用微生物通過促使機(jī)體發(fā)生體液免疫和細(xì)胞免疫，提高畜禽抗體水平，增強(qiáng)免疫功能，及時(shí)殺滅侵入機(jī)體內(nèi)的致病菌，從而防止疾病的發(fā)生。實(shí)驗(yàn)發(fā)現(xiàn)乳酸桿菌能夠增強(qiáng)機(jī)體的免疫能力,一些益生菌能夠影響人體免疫系統(tǒng)的應(yīng)答能力,其影響能力隨菌體的不同而變化。