由于青霉素類獸藥本身所具有的特性，畜禽等動物的種類不同，所患疾病的嚴重程度不同，以及由不同的病原微生物所引起的不同疾病，故青霉素類獸藥在臨床應用時，常有以下不良反應及應注意的事項：


（1）過敏反應：青霉素類獸藥用于動物機體一般無不良反應，但對個別家畜偶見有過敏反應，如蕁麻疹、水腫等，嚴重者可產生過敏性休克。在馬、豬中出現流汗、不安、肌肉震顫、流涎、呼吸困難、站立不穩、心跳加速、抽搐等癥狀。如出現上述癥狀，應立即停止使用青霉素類獸藥，同時可用腎上腺素注射液或氫化可的松進行搶救。


（2）在使用青霉素鉀鹽時，應注意畜禽等動物的血鉀變化，一般禁止大劑量使用，特別對高血鉀患畜禁用。


　　（3）不宜空腹注射，以免患畜血糖較低而引起昏厥。


（4）不宜與四環素類、氨基甙類、多粘菌素E、兩性霉素B、磺胺藥鈉鹽以及碳酸氫鈉、維生素C、去甲腎上腺素、阿托品、氯丙嗪等混合應用。


（5）不應隨意加大劑量。大劑量或超大劑量使用青霉素類獸藥，可干擾凝血機制而造成出血或引起中樞神經系統中毒，引起動物抽搐、大小便失禁、甚至癱瘓等癥狀。也可使耐藥菌迅速產生分解青霉素的β-內酰胺酶。所以在獸醫臨床上，應嚴格掌握正確的使用方法和劑量，不要隨意加大劑量對付耐藥菌，而應換用其他有效的抗菌藥物。確因病情需要加大使用劑量時，應嚴格控制在有效范圍每日2000萬單位以下。


（6）青霉素類獸藥應即溶即用。由于青霉素類獸藥在干燥狀態下較穩定，在室溫下溶解的時間越長，其效價就越低，分解產物也就越多，致敏物質也就不斷增多。所以青霉素類獸藥應即溶即用，確保藥效準確，毒副作用小。