藍耳病和圓環病毒感染，是當前養豬場普遍存在，并且最難以對付的兩種疾病。由于當前國內市場上還沒有針對這兩種疾病的免疫效果確切的疫苗供應，因此自家組織苗作為預防這兩種疾病的一種無奈選擇，正在全國各地大小豬場被廣泛使用。
　　2002年前后，當自家組織苗最初開始在豬場推廣使用時，的確取得了顯著的效果，對豬場有效地預防藍耳病和圓環病毒感染，發揮了巨大的作用，使很多瀕臨倒閉的豬場因此而起死回生。但問題是很多人過分地夸大了自家組織苗的作用，有的豬場場長和技術人員，對自家組織苗甚至到了迷信的程度。曾經有一個豬場場長介紹他的養豬經驗，說他平時其他工作基本都不用管，只要監督制作好自家組織苗就可以了，以致他們豬場的病豬根本看不到肺臟病毒性病變，仍然堅持采集病豬的肺臟制作自家組織苗。
　　目前，很多養豬技術人員對自家組織苗的認識，最起碼存在下列兩大誤區。
　　第一、自家組織苗可以長期使用 
　　自家組織苗的效果，取決于病變組織中病毒的含量。2002年當自家組織苗剛開始推廣使用時，由于之前豬場一直沒有使用過有效的疫苗，發病豬癥狀都比較典型，病變組織中病毒含量較多，而且每批采集的病料中病毒含量的變異度也不大，所以自家組織苗的效果顯著而且穩定。但是，隨著疾病逐漸得到控制，典型的病料越來越難以獲得，通過采集自然發病豬的病變組織制作自家組織苗，效果將越來越差，這是使用自家組織苗的必然規律。事實已經證明很多豬場在使用自家組織苗一段時間后，效果確實越來越差，不但藍耳病或圓環病毒依然存在，而且其他疾病也越來越難以控制。所以自家組織苗只能是臨時應急的一種措施，不能長期使用。長期使用自家組織苗，將給豬場帶來一系列風險。
　　第二、自家組織苗包醫百病
　　很多技術人員都認為，只要是豬場存在的疾病，自家組織苗中都會含有相應的抗原，所以使用本場發病豬病變組織制作的自家組織苗，可以預防豬場存在的所有疾病。這種認識是非常錯誤的。作為一種疫苗，要使其對特定的傳染性疾病產生免疫作用，必須具備兩個條件：①疫苗中必須含有相應的具有免疫原性的抗原；②抗原的劑量必須符合一定的要求。抗原量太少，無法有效產生抗體；此外，抗原量太多或太少，還有可能誘導免疫耐受。自家組織苗通常都是通過采集病豬的病料來制作的，然而各種病原對組織的嗜好是不一樣的，藍耳病病毒在肺部含量較多，而豬瘟病毒因其嗜內皮細胞的特性，使其在腎臟和免疫器官含量較多。如果把病豬所有內臟一起搗碎制苗，各種抗原都將被稀釋，很難達到有效免疫的抗原量。所以，我們制作自家組織苗，都是有針對性的，疫苗用于預防什么疾病，就應該選擇什么病原含量最多的器官或組織制苗。