根據臨床病理變化的特點不同，可將本病分為喉氣管型和結膜型兩種。
1、結膜型 主要病變雖然發生于眼結膜，但也有的病例常與喉、氣管病變合并發生。眼結膜病變主要呈漿液性結膜炎的變化，表現結膜充血、水腫，偶見點狀出血，有些病雞的眼瞼，特別是下眼瞼發生水腫，而有的則發生纖維素性結膜炎。在結膜囊內沉積纖維素性干酪樣物質而使上下眼瞼粘連一起，角膜渾濁，嚴重者發生全眼炎。
2、喉氣管型 主要病變位于喉和氣管。在喉和氣管內存有卡他性或卡他出血性滲出物，呈乳酪狀或血凝塊狀堵塞喉和氣管。而另一些病例，則于喉和氣管內存有纖維素性的干酪樣物質。干酪樣滲出物從粘膜脫落后，可見粘膜出血，敞在點狀或斑點出血，輕度增厚。
鼻腔和眶下竇粘膜也發生卡他性炎喉頭粘膜充血和腫脹，出血、充血、壞死，散布小點狀出血，偶見鼻腔粘膜有滲出物中帶血凝塊或呈灰黃色纖維素性干酪樣物。口腔粘膜，特別是在舌根、口角、口蓋裂隙及咽喉出口處見有易脫的白色薄膜。
此外，其他器官除腸管粘膜呈現輕度出血性卡他性炎外，心內外膜、肝被膜、胰腺及胸腺偶見少數點狀出血，各實質器官顯示實質變性，肺臟呈現小支氣管周圍炎，偶見氣囊出現白色渾濁或肥厚。
雞傳支變異株的防治
搜牧網（中國禽病網）,雞傳染性支氣管炎是由傳染性支氣管炎病毒引起的一種急性高度接觸性傳染病。由于傳支病毒容易重組和變異，造成血清型較多，目前已經發現有30多個毒株，20多個血清型，且不同血清型之間交叉保護較低，給傳支的預防和控制帶來困難。根據出現新的變異株實時調整免疫程序，在免疫程序中采用多種毒株聯合使用，以提供廣譜保護，是預防和控制雞傳染性支氣管炎的有效方法。雞傳染性支氣管炎的預防和控制要特別重視變異株的出現，對此應該做好以下幾方面的工作：
（1）強化生物安全措施：
　　進雞前應該建立良好的生物安全措施，如：嚴格的隔離、清洗和雞舍消毒等。同時應該加強育雛期的飼養管理，保持溫濕度的穩定，減少雞群的應激是預防本病的關鍵。
　　（2）活疫苗免疫
　　及早進行活毒疫苗免疫，提供上呼吸道上皮細胞局部免疫保護。在7～14天進行初免，開產前再加強免疫一次。
　　（3）滅活疫苗免疫
　　一般用于種雞和蛋雞的加強免疫，加強抗體的產生，并對內部器官提供保護。
　　多血清型疫苗聯合使用：由于傳染性支氣管炎病毒血清型較多，且型間交叉保護作用較低，免疫時應該交叉使用不同血清型的疫苗，以提供較為廣譜的保護。