臨床上大部分疾病都是呼吸道的繼發感染，所以要重視引起呼吸道疾病的因素。
1、疫苗接種的應激反應
在獸醫臨床上，疫苗免疫是疾病防控過程中最主要的措施之一，但是，肉雞的呼吸道黏膜也受疫苗的刺激發生一定的應激反應。在畜牧生產實踐中，由于大量使用法氏囊或新城疫疫苗導致的免疫抑制，是引發肉雞呼吸道疾病的重要原因之一。
2、氣候因素
例如氣候的變化，溫度忽冷忽熱，都會為病原體的感染提供條件。應激可以導致機體的抵抗力減弱，抗應激能力降低。再者轉群也是機體容易感染呼吸道疾病的原因之一，再加之天氣變化等應激因素存在時，容易引起雞只咳嗽等呼吸道癥狀疾病。
3、環境衛生因素
沒有嚴格的環境衛生管理制度，例如經常不消毒或者消毒不及時，再者由于雞場地勢低洼、糞便堆積、高密度飼養、通風不好，使得雞舍內有害氣體不能有效排出，特別是硫化氫、氨氣、甲烷等氣體嚴重超出標準，刺激機體呼吸道黏膜，容易使機體的組織缺氧，呼吸道及肺呼吸的功能下降，致使機體的抵抗力下降，機體變成了易感動物群，外界的一些病原微生物容易侵入機體內。
4、疾病防治不科學
在動物生產實踐中，由于疫苗預防不科學或不及時，錯過了疫苗最佳的免疫時間，導致疫苗免疫滯后，使這種免疫達不到應用的效果。同時由于一些藥物治療不科學，像有些疾病的毒株或耐藥株不斷突變，常常導致臨床治療無效。如果使用藥物的濃度或作用時間不佳，可導致耐藥菌株的增多，降低了藥物治療細菌性疾病的療效。
