發病雞群往往不是由單一病原體引起，大部分表現為混合感染。因此在診斷時要根據具體情況多問多解剖并仔細觀察，以準確診斷，有效治療。
1、敗血性支原體
支原體在很多雞舍中廣泛存在。當環境變化，免疫接種和應激等因素導致雞群呼吸系統受損或抵抗力下降時支原體很容易感染雞群。支原體感染的雞群會表現出咳嗽、噴嚏、流淚、面部腫脹等癥狀，剖檢可見氣囊炎。
2、大腸桿菌
大腸桿菌是雞舍內的常在菌，常見于其它傳染病感染雞群后，發生大腸桿菌的繼發感染，進一步加重病情，導致死淘升高。呼吸道疾病繼發大腸桿菌感染會表現出死淘升高，剖檢可見嚴重的氣囊炎，心包炎，肝周炎和腹膜炎等病理變化。
此外，傳染性支氣管炎，傳染性鼻炎和傳染性喉氣管炎等也很容易在秋冬季節出現。