引起傳染性胚胎病的病原微生物，有的是在患病或病愈的母禽體內，在蛋的形成過程中，以內源性途徑進入蛋內。
1.禽腦脊髓炎 帶有本病毒的種蛋在孵化的第1周，死亡較多，而在出殼前2～3天又出現死亡高峰期，能出殼的很快出現本病特有的頭頸震顫和共濟失調的特征性癥狀。死胚可見胚體出血，腎臟和尿囊內沉積有尿酸鹽。肌肉變性、腫脹、斷裂、橫紋消失和發生壞死。腦組織發生軟化、水腫，并有膠質細胞增生。
2.鴨病毒性肝炎 成年母鴨患本病無臨診癥狀而所產種蛋可有10%～60%帶有本病菌毒。患本病的胚胎死亡可達50%。死于胚齡第10～15日的胚胎，有點狀出血和水腫，出血多見于頭部和肢部。卵黃囊血管充血。死于孵化驗15日以后的胚胎，尿囊液呈淺綠色或乳白色，粘稠密而透明。有時可見兩腿肌肉萎縮，頭部瘀血，肝腫大，呈青綠色或淡黃色，色澤不均勻而呈斑駁狀。尿囊和卵黃囊血管充血。胚外膜水腫。
3.包涵體性肝炎 本病是一種由腺病毒引起的經蛋傳遞的傳染病。種雞受感染后無明顯的臨診癥狀，但種蛋的孵化率明顯下降，雛雞死亡率增高。將本病毒接種于雞胚的卵黃后5～10天，雞胚即告死亡，對外開放胚的肝細胞中常可發現核內包涵體。如將病毒接種于雞胚的絨毛尿囊膜上，則可形成壞死性病灶。死胚的皮膚出血。
4.減蛋綜合征 減蛋綜合征也是一種由腺病毒引起的經蛋傳遞的傳染病。患病雞群可能出現輕微呼吸道癥狀，感染后顧之憂周內產蛋率和蛋殼質量下降，種蛋孵化率下降。將本病毒人工感染雞胚，胚胎發育不良，胚體蜷縮，死胚充血和出血。
5.病毒性關節炎 本病是由呼腸孤病毒引起的經蛋傳遞的傳染病。本病可使雞群的產蛋量下降10%～15%，種蛋受精率也下降。如將本病毒接種于雞胚的卵黃囊，可使雞胚3～5天內死亡，胚體充血、出血。較遲死亡者，發育不良，胚體暗紫色。肝、脾、心腫大，并有小的壞死點。若接種于絨毛尿囊膜，可引起尿囊膜水腫、增厚，有白色或淡黃色的痘斑，若將其做成組織切片，則可見胞漿內包涵體。
6.禽白血病 本病是由禽白血病/肉瘤病毒群的病毒引起的禽類腫瘤性病毒的統稱。可經蛋傳遞，其中的一些病毒可在雞胚的絨毛尿囊膜上繁殖，并形成痘斑。若將病毒接種于卵囊內，雞胚的一些組織器官會出現腫瘤，胚胎發育不良，肝、脾極度腫大，而且死亡很高。