原蟲病是由原生動物寄生于動物而引起的一類寄生蟲病。原蟲是一種單細胞動物，常寄生于動物的體腔、體液、組織和細胞內，可以致病或不致病，對肉鴿危害比較嚴重的主要有球蟲病、毛滴蟲病、六鞭原蟲病和瘧原蟲病等。
1 鴿球蟲病
1.1 主要特點 鴿球蟲病是由艾美耳屬球蟲寄生于腸道引起的一種疾病，鴿很易感染，尤其對幼鴿危害嚴重。其傳播的主要途徑為消化道感染，死亡率較高，可達15%以上。幼鴿發病時的特征性癥狀是，排褐色糊狀稀糞，間或排血便，貧血癥狀明顯。此外，表現為精神不振，采食下降，羽毛松亂無光，翅膀下垂，日趨消瘦，很易死亡。病程在5～20天不等。剖檢主要病理變化在小腸，表現為腸道卡他性或出血性炎癥，腸壁充血、腫脹，有結節，腸腔充滿凝固的糞血塊。
1.2 預防措施 加強飼養管理，搞好清潔衛生，有計劃的進行藥物預防。喂給配合飼糧，滿足肉鴿營養需要，增強機體抵抗力;平時加強環境衛生管理，定期消毒，及時清除糞便及墊草;發現病鴿及時隔離治療，并供給充足的營養，補充維生素;有計劃地在飼料中添加抗球蟲的藥物進行預防，如氨丙啉0.0125%～0.025%，磺胺喹嗯啉0.006%～0.025%，地克珠利1×10×E－6等，可較好地控制該病的發生。
1.3 治療措施 一旦發生該病后，可及時采取以下措施進行治療。
1.3.1 磺胺二甲氧嘧啶0.05%～0.1%混入飼料或按0.025%～0.05%的濃度飲水，連用2～4天。也可以選用三字球蟲粉。
1.3.2 百球清2×10×E－6飲水或拌料，連用3天。也可以配合一些中藥如常山、柴胡、白茅根等進行治療。在用藥治療期間，應添加維生素，尤其是維生素A、維生素B、維生素K等。
2 毛滴蟲病
2.1 主要特點 鴿毛滴蟲病是鴿最常見的一種具有傳染性的原蟲病，任何品種、性別、齡期的鴿子均會發生，但1～8周齡幼鴿可出現嚴重癥狀與死亡。病原主要通過消化道、傷口及未閉合的臍孔進行傳播。溫熱、潮濕天氣更為多發。潛伏期3～15天，病程在4～25天不等。其主要癥狀及病變表現為病鴿常有吞咽動作，閉口困難，口腔內流出氣味難聞的液體;食欲大減，飲欲增加，消化紊亂，體重很快下降，消瘦，拉黃綠色稀糞;羽毛松亂，眼內有水狀分泌物;死前病鴿眼結膜、口腔黏膜發紺，個別病鴿張口呼吸、咳嗽、氣喘。剪開病鴿口腔、咽、食管、胃，見到黏膜上有黃白色干酪樣物，形成偽膜;有的隆起呈紐扣狀，氣味難聞，有的連成一片，堵塞了食道。肝臟表面有圓形或環狀的綠豆大、有的玉米大小的白色或黃色病灶。有的腸黏膜增厚，表面有糠麩樣滲出物。有的呼吸道有黏液。在生產中有的以咽部癥狀為主，也有的以內臟癥狀為主，還有表現臍部癥狀的，要注意觀察。該病診斷可以結合病理剖檢變化，然后取用生理鹽水沾濕的棉簽，刮取病鴿口腔、嗉囊黏膜黏液置于載玻片上制成壓片，400倍光學顯微鏡暗視野觀察，發現有許多梨形或橢圓形可活動的蟲體，前端有4條鞭毛，邊緣有一可波動的薄膜。由此確診為鴿毛滴蟲病。
2.2 預防措施 加強飼養管理，注意保持環境、運動場、欄舍、用具及飼料飲水的清潔衛生，特別是飼槽和墊料的衛生，做到每籠使用一個水槽，防止交叉感染;不同月齡的鴿應分群飼養;保持飼料的新鮮干凈;清除設施的尖刺物，避免鴿體受傷;定期檢查病原，發現帶有蟲體的感染鴿立即隔離治療，并對全群采取藥物預防，以防繼續傳播。也可以在乎時的保健砂中加入殺蟲中草藥如青蒿、蛇床子、花椒等。
2.3 治療措施 用0.05%的二甲硝咪唑溶液飲水，連用2～3天，或按每100kg飼料添加40g混飼，連用5天;"鴿滴凈"按0.1%的濃度飲水2～3天;甲硝噠唑，按0.05%飲水，連用2～5天。為確保療效，用藥后間隔5～7天可以再用藥一次。
3 六鞭原蟲病
3.1 主要特點 本病是由火雞六鞭原蟲引起的，主要感染1～9周齡的火雞、鴿，鴨、雛雞、雉雞、鵪鶉，孔雀及鷓鴣也可感染發生。本病對幼鴿的危害較大，如不及時治療，死亡率可高達75%。主要經口感染，發病鴿以卡他性腸炎與泡沫性腹瀉為主要癥狀。病初有神經質表現，敏感性增高，活動異常，畏寒，病鴿扎堆，嗚叫，食欲減退，排水樣或泡沫樣糞便;后期精神沉郁，脫水消瘦，羽毛松亂無光，由水瀉變為黃色稀糞，最后衰竭昏迷，掙扎后死亡。剖檢病變主要在腸道發生卡他性炎癥，繼發腸臌脹，腸內有水樣或泡沫樣液體，肝臟有淺黃色的變色區。在顯微鏡下觀察，腸腺窩內有大量的六鞭原蟲。
3.2 防治措施 可以參照鴿毛滴蟲病的防治措施，但注意用藥時間，不管是預防還是治療，一般連續用藥3～6天。此外，本病還可以使用抗菌藥物進行治療。在飼料中添加0.0375%的丁醇錫或金霉素0.0055%等也具有較好的治療作用。
4 瘧原蟲病
4.1 主要特點 本病是瘧原蟲科鴿血變原蟲引起的一種疾病，一年四季均可發生，吸血昆蟲是主要傳播媒介，如鴿虱、蚊、蠅、蜢等。在吸血昆蟲孽生期，如夏、秋季節，最易發生本病的傳播與流行。幼鴿發病表現急性經過，食欲不振，頭縮毛松，貧血消瘦，呼吸加快或張口呼吸，部分病鴿體溫偏低，數日內死亡，死亡率可達65%～75%。成鴿感染本病病原時，一般癥狀不明顯，數日可自行恢復;有的轉為慢性，但其抗病力、繁殖力下降，不愿孵化和哺育乳鴿，體質衰弱、貧血、消瘦等。剖檢可見血液凝固不良，高度貧血，心肌可見出血，肌胃增大，肺水腫，肝、脾、腎腫大和硬化等病變。用內臟器官或血液涂片，羅曼諾夫斯基染料染色可見到紅細胞中的滋養體或瘧疾色素殘余物。
4.2 預防措施 加強飼養管理，保持環境的清潔衛生。成功預防依賴于中斷瘧原蟲的生活史，徹底消滅吸血昆蟲，尤其是蚊子，避免傳播。在保健砂中加入5%的青蒿全粉可有良好的預防作用。
4.3 治療措施 磷酸伯氨喹啉片或磷酸氯喹片（每片含0.7mg），每片喂4只鴿子，每天一次，首次劑量加倍，連用7天，也可混于飲水中讓鴿子自由飲用。