在臨床用藥中，抗菌藥、抗生素得到廣泛應用，同時也很容易混淆，應該該如何區分呢？應注意以下幾個方面：

抗菌藥和抗生素是大概念和小概念的關系，抗菌藥包含抗生素。

一般來說，抗菌藥是指一類對細菌有抑制或殺滅作用的藥物，除一部分來自于自然界某種微生物的抗生素外，還包括人工合成的抗菌藥，比如磺胺類、喹諾酮類等；一部分來源于微生物的抗腫瘤藥物也屬于抗菌藥。完全由人工化學合成的抗微生物藥物，不能稱為抗生素，應該稱之為抗菌藥。如生活中常用的諾氟沙星、環丙沙星、甲硝唑等。抗菌藥物的作用是抑制微生物的生長，主要是抑制細菌、霉菌、衣原體和支原體的生長，用于感染性疾病，但對病毒性感染無效。

抗生素是抗菌藥中的一類，是由細菌、霉菌或其它微生物在生活過程中所產生的具有抗病原體或其它活性的一類物質，如青霉素、頭霉素類、氨基糖苷類等。

自1940年青霉素應用于臨床以來，現抗生素的種類已達幾千種。在臨床上常用的亦有幾百種。其主要是從微生物的培養液中提取的或者用合成、半合成方法制造。

目前，我國可供臨床選用的各類抗菌藥物達到200多種，占世界上現有品種的90%以上，基本上可以滿足治療各類微生物感染性疾病的需要。

國家權威部門發布的相關規定中，明確使用了“抗菌藥”這一名詞，如“未被列入非處方藥藥品目錄的抗菌藥物須憑處方在藥店購買”。

“抗菌素”這一名詞在1982年就被取消，這一醫學術語已經不復存在了。這是因為抗菌藥的效用是多方面的，不僅能抑殺細菌，還能作用于心血管等疾病的治療，如他汀類藥物等。