消毒，一直是大家認為的最好的控制疾病的方法，且噴霧消毒是控制環境消毒的最好方法，既能控制舍內塵埃的飛揚，也能控制舍內病原體及有毒氣體的釋放，但是消毒也不是完全沒有弊端，尤其是能提高舍內濕度，不利于控制法氏囊病和球蟲病的發生。所以在法氏囊病和球蟲病的高發季節則減少噴霧消毒的次數，適量結合飲水消毒，以提高消毒效果。

有機酸，能夠凈化飲水，防止水中生物膜形成，調節消化系統pH值，促進飼料生物利用率，殺滅胃腸道內致病菌等等。在市面上已經出現食用和消毒劑兩大類的酸制劑，在噴霧或飲用中也都有類似的效果，所以在夏秋季節適量給雞群飲用有機酸制劑，除了可以改善舍內環境，還可以有效地降低胃腸道疾病及球蟲病的發生。