目前，養蝦業已成為海水養殖業中舉足輕重的支柱產業。隨著蝦養殖規模的不斷擴大、集約化程度的提高以及蝦生存環境的變化，疾病的危害程度也隨之增大。近年來，由于健康養殖的需要，中草藥制劑在水產養殖中的應用日趨廣泛。

防治白斑綜合癥病毒

給南美白對蝦喂服中草藥復合制劑對蝦病毒凈，連續投喂5d~7d，每天2次，取得了一定療效，病情都得到了很好的控制，控制率達80%以上，并在一定程度上也控制了白斑綜合癥的傳播。當添加復方中草藥濃度為0.1%時，連續飼喂26d，對蝦抗病力的提高最為明顯。若飼喂時間過短或過長，對蝦抗病力的提高均不明顯，連續飼喂比間斷飼喂效果要好。

防治桃拉綜合癥病毒

將9味中藥(黃芪、豬苓、杜仲、枸杞子、魚腥草、甘草、陳皮、茯苓、黃連)制劑的餌料喂養南美白對蝦，在季節交替期每日投喂中藥，試驗池對蝦桃拉病毒病的平均發病率較對照池低37．2%，試驗池對蝦的平均產量與平均成活率分別比對照池高。在基礎餌料中添加1.5%中草藥復合制劑，經過中試及大面積擴大試驗，發現能夠有效阻斷核酸合成，抑制南美白對蝦傳染性病毒繁殖，同時提高對蝦機體免疫力，可有效預防及治療南美白對蝦由桃拉病毒造成病毒性疾病，且不易反復。

防治弧菌屬細菌所致疾病

在羅氏沼蝦的基礎日糧中添加大黃蒽醌提取物后，12小時、24小時、48小時的羅氏沼蝦試驗組血清溶菌酶活性以及肝胰腺溶菌酶含量均比同期對照組提高，從而提高羅氏沼蝦的免疫水平，降低羅氏沼蝦對鰻弧菌的敏感程度，增強其抗病力。利用抗生素占基礎原料的0.3%～0.6%、中草藥占基礎原料的1.5%～2%的餌料，對6種病原菌引起的中國對蝦“紅腿病”進行防治，防治效果都比較理想，而且病蝦對所投藥餌主動抱食，有利于發揮藥物的作用，提高了防治效果。在基礎飼料中添加中草藥制劑（添加劑由黃芪、板藍根、金銀花、生石膏按比例配制而成），對凡納濱對蝦血清中超氧化物歧化酶、堿性磷酸酶、酚氧化物酶和溶菌酶有顯著影響。

防治嗜水氣單胞菌所致疾病

將大黃、黃芩、黨參、板藍根等10余味組成復方藥物，經粉碎、過篩后按比例添加于基礎飼料中制成顆粒藥餌，能顯著增強青蝦血細胞吞噬百分比和吞噬指數、血清溶菌酶活力，提高了青蝦對嗜水氣單胞菌攻毒的免疫保護率，卡方檢驗結果表明各試驗組與對照組之間差異極顯著，表明添加復方藥物能有效地預防嗜水氣單胞菌對青蝦的感染。

防治其他細菌所致疾病

使用一定量的石營蒲煎煮液和一定量的霍香煎煮液浸泡羅氏沼蝦，對羅氏沼蝦的莫格球擬酵母病具有明顯的治療效果。

防治寄生蟲疾病

寄生蟲疾病是水產養殖的重要疾病之一，其造成的危害僅次于細菌性疾病，其中纖毛蟲和聚縮蟲危害較大。研究表明，重樓甲醇提取物對纖毛蟲的殺滅作用最強。當重樓甲醇提取物濃度達到一定程度時，對寄生在羅氏沼蝦上的纖毛蟲(聚縮蟲和靴纖蟲)殺滅率為100%。將苦參、大黃、百部、貫眾、五倍子單獨粉碎成末，以一定的比例混合，將中草藥用蒸餾水煎煮提取有效成分，采用15mg/L中草藥合劑浸泡中國對蝦，可有效殺滅聚縮蟲而不對中國對蝦產生毒害。