雞場育種工作基本上都是按系譜孵化進行的，因為系譜孵化相對簡單，而且能夠保留雞種，在孵化過程中只要做好系譜記錄即可，詳細內容請看下文介紹。

選種后每只中選公雞要按一定的公母比例與中選母雞組成家系親本，公雞均采用個體輸精，以確保系譜的準確性。若種雞為籠養，則需采取人工授精的方法；若種雞平養，則常用育種小間繁殖，每個小間飼養一只公雞及所有與配母雞。

留種期間，每枚種蛋上都必須標明所屬家系（父親）及母雞號（用鉛筆標在蛋的兩頭），然后進行系譜孵化。系譜孵化的關鍵是出雛期，應將每個全同胞家系（每個母雞）的種蛋集中到一個出雛籠或出雛袋內集中出雛，不同家系以及不同母雞的種蛋必須徹底隔離開，只有這樣才能搞清雛雞的來源，保證個體標記及建立的系譜的準確性。當然，由于育種目標或育種階段的不同，系譜孵化的標記內容和側重點也應有所不同。