一、中西獸藥配伍方法
增效配伍 藥物配伍后，至少有一種藥物療效得到增強。如青霉素與金銀花合用能加強青霉素對耐藥金黃色葡萄球菌的抑制作用。再如蟾酥、牛砂、公丁香(解毒炎丸)可使異煙肼治療淋巴結核的療效明顯增加。
主輔配伍 藥物配伍時將針對主病藥群與針對兼病藥群聯合應用，如抗腫瘤藥物呋喃氟尿嘧啶長期服用，毒性反應大，可使白細胞下降，若小劑量抗腫瘤，可升高白細胞，但與中藥蟾酥水溶液合用，治療食管癌、賁門癌,不僅有協同作用，且能減少或預防呋喃氟尿嘧啶的毒性反應，充分發揮佐治作用。
加法配伍 藥物配伍應用后的療效是各藥療效之和，如辛夷花、蒼耳子、防風、白芷、黃芩、桔梗、半夏等與磺胺類藥合用治療雞傳染性鼻炎。中藥各成分的調和作用與對嗜血桿菌敏感的磺胺作用相加取得較好的療效。
制偏配伍 用一種藥物去防止或減少另一個藥物的毒副作用。如鏈霉素長期使用對腦神經有毒害作用，但是與解毒的甘草酸與鏈霉素合用時，可大大降低鏈霉素的毒副作用；再如環磷酸酰胺與刺五加、三顆針、莪術等合用，不僅降低環磷酸酰胺的制癌作用，而且可以提高療效。
相反配伍 藥物配伍后產生或增加應當防止的嚴重毒副作用，如羧芐青霉素不宜同含苷的中藥配伍，羧芐青霉素不宜與萬年青、夾竹桃、福壽草等含苷的中藥合用，因為羧芐青霉素與它們配伍時，可增強其強心苷（側金盞花糖苷）的敏感性，易誘發中毒反應。
減效配伍 藥物配伍后藥效下降或相互抵消，如堿性西藥如碳酸氫鈉片、胃舒平片、氨茶堿、氫氧化鋁與酸性中成藥如山楂丸(片)、烏梅丸、五味子丸、安胃丸、保和丸等同時服用,會因酸堿中和，降低藥效。
二、中西藥合用的藥動學變化
合用后對藥物吸收的影響 藥物都存在一定的酸堿性，當藥物之間或藥物與肌體環境之間的酸堿不一致時必然會對藥物的吸收產生一定的影響。如五子衍宗湯加減與紅霉素片合用，由于紅霉素在酸性環境中不穩定導致紅霉素幾乎完全分解失效，從而影響藥物的吸收。
再有藥物與藥物之間發生化學反應形成難溶物質時也必然影響吸收，如四環素類藥與含鈣、鎂、鋁、鐵等金屬離子的天然中草藥易形成溶解度小，不易被胃腸吸收的絡合物，從而使含金屬的離子的藥物失效而降低療效。四環素與含鞣質中草藥虎杖、石榴皮、五倍子、烏梅等配伍，可發生反應形成不溶性的沉淀物而影響吸收。
還有一些與機體有關的因素,如茵陳與灰黃霉素合用，茵陳的有效成分對羥基苯乙酮有較明顯的利膽作用，能促進膽汁酸、膽鹽等表面活性劑的分泌，這些活性劑能增加難溶性藥物的灰黃霉素的溶解度,從而促進其在腸內的吸收而提高療效。
合用后對藥物分布的影響 中西藥聯合應用時，對分布的影響體是雙向的，它可同時影響中藥和西藥在動物體內的分布，從而使合用后的療效增強或減弱。如枳實與慶大霉素合用治療膽道感染時，因枳實能松弛膽道的總管括約肌，從而降低膽道內的壓力，提高慶大霉素的有效濃度，影響藥物的分布，提高療效。
合用后對藥物轉化的影響 藥物多在動物的肝腎內代謝，有些中西藥組方會產生代謝障礙而引起藥效的改變。如磺胺類藥物與山楂、烏梅、五味子等富含有機酸的中草藥組方，會影響磺胺藥的療效。這是因為磺胺藥在肝內代謝的產物是乙酰化的磺胺，這個代謝過程需要堿性環境，與酸性藥合用會影響其轉化，降低療效。
腎臟是藥物排泄的主要器官 藥物合用后可能在不同程度上影響藥物與腎臟之間的關系從而影響到藥物的排泄。如新霉素與烏梅、雄黃配伍，烏梅可使尿液酸化，則使堿性新霉素等氨基糖苷類抗生素排泄增加，在腎小管重吸收減少，影響療效。
三、臨床常見的中西藥合用
中藥與抗生素合用 青霉素與金銀花、魚腥草、青蒿、板藍根、蒲公英合用有協同作用；鏈霉素與骨碎補合用可以消除鏈霉素的耳毒性和過敏反應。
中藥與抗寄生蟲藥合用 常山、柴胡與鹽霉素合用治療雞球蟲病；抗血吸蟲病酒石酸銻鉀與法半夏、甘草合用能減輕酒石酸銻鉀對胃腸道的刺激，并能解除平滑肌痙攣起協同作用；呋喃丙胺與檳榔合用可以提高呋喃丙胺對血吸蟲的驅蟲效果；敵百蟲與大黃合用能增強對膽道蛔蟲的驅蟲效果；驅蛔蟲的枸櫞酸哌嗪與苦楝根皮合用可以提高驅蟲效果。但是堿性奎寧與甘草合用可以產生沉淀，影響吸收，降低療效。
中藥與鎮靜藥合用 氯丙嗪與地龍合用可以減輕氯丙嗪對消化系統和肝臟的不良反應，減輕毒副作用；戊巴比妥與靈芝、山楂、香附合用可產生協同作用；環己巴比妥納與蟬蛻、秦皮、附子、丹參等合用能產生協同作用。
中藥與作用于消化道的藥合用 碳酸氫鈉與廣木香、高良姜合用可以提高胃腸潰瘍的治愈率；氫氧化鈉與黃芪、白芨合用可以發生相加作用提高療效。灰黃霉素與茵陳合用可以增加灰黃霉素的溶解度和吸收率，有協同作用。
但是氨基苷類抗生素與硼砂合用 可以增強耳毒性，不宜同用。具有單胺氧化酶抑制作用的抗生素與麻黃配伍可導致血壓升高；四環素與石膏及含石膏的中成藥配伍可降低抑菌效果；磺胺藥與四神丸合用可引起血尿。但酶制劑不宜與黃連、黃芩等合用，可使酶制劑活性降低，影響療效。
綜上所述，中西藥之間的配伍，既不是簡單的湊合，也不是機械地相加，而是有理論、有根據、有機地相結合。在中西藥配伍時，既要重視運用有益的配伍，以增加療效及藥物的穩定性，又要防止因配合而發生的配伍禁忌。避免給病畜造成痛苦和危害，起到標本兼治的作用。