從流行病學上進行鑒別：

仔豬黃痢：最容易發作于1～3日齡的仔豬，個別仔豬在生后12h發病。發病率與病死率較高。

仔豬白痢：多發作于10～30日齡的仔豬，發病率中等，病死率低。

仔豬紅痢：首要損害1～3日齡的仔豬，1周齡以上仔豬很少發病，發病率高，病死率低。

從臨床表現和病理變化上進行辨別

仔豬黃痢：排出黃色漿狀稀糞，內含凝乳小片，很快消瘦、昏倒而死。胃腸道膨脹、有多量黃色液體內容物和氣體，腸黏膜呈急性卡他性炎癥，小腸壁變薄。

仔豬白痢：糞便呈乳白色或灰白色，漿狀或糊狀，腥臊、粘膩。腸黏膜有卡他性炎癥病變。

仔豬紅痢：排出血樣稀糞，內含壞死安排碎片。空腸呈暗紅色，腸系膜淋巴結鮮紅色，脾邊際有小點出血，腎呈灰白色。

豬痢疾：胃口減少，糞便變軟，外表附有條狀粘液，以后糞便黃色柔軟或水樣，直至糞便充溢血液和粘液。大腸黏膜腫脹，并掩蓋有粘液和帶血塊的纖維素，內容物軟至淡薄，并混有粘液、血液和安排碎片。

豬傳染性胃腸炎：仔豬糞便為黃色、綠色或白色，可富含未消化的凝乳塊。成年豬有吐逆、灰色褐色水樣拉肚子。胃底黏膜充血、出血，腸系膜充血，淋巴結腫脹，腸壁變薄呈半透明狀。

豬盛行性拉肚子：水樣拉肚子，嚴峻脫水，精力沉郁，胃口減退。小腸擴大，內充溢黃色液體，腸系膜充血，腸系膜淋巴結水腫，小腸絨毛縮短。

仔豬副傷寒：耳根、胸前、腹下及后軀部肌膚呈紫紅色，糞便惡臭，呈淡黃色或黃綠色，并混有血液、壞死安排或纖維素絮片。脾腫大、質地較硬，呈暗紫紅色，全身淋巴結充血、腫脹，腸系膜淋巴結腫大呈索狀。

豬輪狀病毒病：糞便水樣或糊狀，色暗白或暗黑。胃壁緩和，內充溢凝乳塊和乳汁，小腸壁綿薄，廣泛出血，腸系膜淋巴結腫大。

豬球蟲病：水樣或脂樣拉肚子，糞便從淡黃到白色，惡臭。纖維素性壞死性腸炎，局灶性潰瘍。

豬痢疾：各種年紀的豬和不一樣品種豬均易感，但7～12周齡的小豬發作較多。本病盛行無時節性，繼續時間長。

豬傳染性胃腸炎：10日齡以內仔豬病死率高，5周齡以上豬的死亡率低，成年豬簡直不死。通常多發作于冬、春季，發病頂峰為1～2月份。

豬盛行性拉肚子：各種年紀的豬都感染，哺乳仔豬、架子豬或肥育豬的發病率高。本病多發作于冰冷時節，以12月和翌年1月發作最多。

仔豬副傷寒：常發作于6月齡以下的仔豬，以1～4月齡者發作較多。本病一年四季均可發作，在多雨濕潤時節發病較多。

豬輪狀病毒病：多發作于8周齡以內的仔豬。本病在晚秋、冬天和早春時節多發。

豬球蟲病：首要損害初生仔豬，1—2日齡感染時表現嚴峻。

從感染病原和臨床特征上進行鑒別：

仔豬黃痢：是由致病性大腸桿菌導致的一種急性、致死性疾病，臨床上以拉肚子、排黃色或黃白色糞便為特征。

仔豬白痢：是由致病性大腸桿菌導致的一種急性腸道流行癥，臨床上以排灰白色、腥臊、糨糊狀稀糞為特征。

仔豬紅痢：是由C型產氣莢膜梭菌導致的一種高度、致死性的腸毒血癥，臨床上以血性下痢、病程短、病死率高、小腸后段的彌漫性出血或壞死性變化為特征。

豬痢疾：是由致病性豬痢疾蛇形螺旋體導致的一種腸道流行癥，臨床上以大腸黏膜發作卡他性出血性炎癥，纖維素壞死性炎癥，粘液性或粘液出血性下痢為特征。

豬傳染性胃腸炎：是由豬傳染性胃腸炎病毒（屬冠狀病毒）導致的一種高度觸摸性腸道疾病，臨床上以吐逆、嚴峻拉肚子和脫水為特征。

豬流行性拉肚子：是由豬流行性拉肚子病毒（屬冠狀病毒）導致的一種急性觸摸性腸道流行癥，臨床上以吐逆、拉肚子和脫水為特征。

仔豬副傷寒：是由沙門氏菌導致的一種疾病，臨床上以敗血癥、腸炎、使懷孕母畜發作流產為特征。

豬輪狀病毒病：是由輪狀病毒（屬呼腸孤病毒）導致的一種急性腸道流行癥，臨床上以拉肚子和脫水為特征。

豬球蟲病：是由球蟲導致的一種疾病，臨床上以水樣或脂樣的拉肚子為特征。