目前，養羊業逐漸成為農村養殖業的一支生力軍，但傳統的養羊飼養管理粗放很難獲得較大的經濟效益，隨著養殖畜牧業的發展，各種各樣的現代化養殖場相繼出現。如何搞好防疫工作，已成為所有養殖場中最主要的問題，疫情一旦發生，將嚴重影響畜牧業的發展，造成巨大的經濟損失。因此，原種場對疫病的控制和預防，應采取一定的措施和制定相應的準則和標準，以保證種畜禽的沿續和質量的穩定提高。另外，還應嚴格貫徹國務院頒發的《家畜家禽防疫條例》，預防畜禽傳染病的發生和傳播。
1 建立健全完善的防疫制度
防疫工作是一項復雜的系統工程，它涉及從生產到銷售，從場內到場外，到全場的工作人員，自始至終貫穿整場，與之息息相關。因此，必須把防疫工作納入正常的管理，由獸醫人員監督執行的全體人員參加的全防體系。把防疫原則，制度貫穿于每一個環節，嚴格規程操作，才可避免疫病的發生，防疫制度才能得到確實的落實。
1.1 科學的程序消毒，是切斷傳播途徑的重要措施。通過定期消毒，可殺滅環境中的細菌、病毒，減少寄生蟲，預防疾病的發生。要建立定期消毒制度。首先大門口要設立消毒池，經常保持消毒液的有效濃度；其次在正常情況下每周消毒1次，疫病發生時每周消毒3次。可用生石灰、燒堿、有機氯制劑、絡合碘、季銨鹽類等消毒藥，對不同場所進行消毒。具體消毒程序：清除場內各種污物，用清水把場內沖洗干凈，再用消毒藥噴灑消毒以保證消毒質量。
1.2 全進全出制。由于采用“全進全出”飼養方式后，生產和運輸都比較集中，可能造成進雛量大，育雛、育成設備使用不經濟等。在實際生產中，對于大的飼養場來說，全場采用 “全進全出”制的情況較少，一般采用整棟舍的 “全進全出”制生產。 在欄舍內有羊的情況下，始終難以徹底清潔、沖洗和消毒。全進全出制度可以通過隔離將發病率講到最低，有利于疾病的控制。
1.3 人員進出登記工作和洗澡更衣記錄。
2 制定科學的免疫程序，按時進行預防接種。
免疫接種是提高機體特異性抵抗力，降低動物易感性的重要措施。但是，如果運用不當，常會收到不滿意的效果。為此，要注意：
2.１ 制定周密的免疫接種計劃。接種各種疫苗需經一定時間才能產生堅強的免疫力，故應根據各種傳染病的發病季節，做好相應的免種計劃，按規定程接種。
2.2 要有科學的免疫程序。畜禽在身體狀況不良時，不能進行接種。有些母源抗體也可以影響和干擾抗體的滴度，甚至完全抑制抗體的產生。為了防止此種現象的發生，對某些傳染病應進行母源抗體的監測，如無條件，可根據經驗確定初次免疫時間。免疫接種對體質健壯的成羊會產生很強的免疫力，對幼羊、體弱或患慢性疾病的羊效果不佳。而對于懷孕母羊，特別是臨產前的母羊，接種時由于驅趕、捕捉和疫苗反應等有時會引起流產、早產，影響胎兒發育和免疫效果不佳。應該注意，對于疾病威脅區不應考慮上述結果，為確保羊群健康，應緊急預防，接種疫苗。
2.3及時驅蟲健胃。寄生蟲是危害養羊業的重要疾病。寄生蟲主要有螨蟲、絳蟲、胃腸道線蟲、肝片吸蟲等。定期進行驅蟲，一般每季度進行1次，最好是丙硫苯咪唑和伊維菌素同時使用。具體用法：羊每公斤體重內服丙硫苯咪唑15毫克，同時用0.1%的伊維菌素注射液按羊每公斤體重0.2毫升肌注，這樣聯合用藥對上述寄生蟲都有較好的驅殺作用。
羊寄生蟲病程序化防治模式使單一寄生蟲防治改為主要寄生蟲整體的有序防治，使零星間斷的治療改為有組織、連片的預防措施，使羊群中的寄生蟲得到全面驅治和預防提高了綜合防治效果。推薦使用藥物：市場上有-害獲滅、阿維菌素、阿力佳、阿福丁、克蟲星、等商品名，其特點是抗蟲譜廣，對絕大多數線蟲，外寄生蟲及其它節肢動物都有很強的驅殺效果（蟲卵無效）。另外它還具有高效、低毒、安全等特點。在臨床應用中具備以往抗寄生蟲藥不可替代的優點：其一是通過內服對體內外寄生蟲有防治效果；其二是不與其它驅蟲藥產生交叉抗藥性。使用程序：（1）母羊在接近分娩時進行產前驅蟲，避免產后在4-8周發生糞便蠕蟲卵“產后升高”。在寄生蟲污染嚴重地區必須在產后3-4周進行驅蟲。（2） 幼畜一般在當年8-9月進行首次驅蟲，保護羔羊的正常生長發育。另外，由于斷奶前后的幼畜受到營養應激，易受寄生蟲侵害。因此，此時要進行保護性驅蟲。（3） 每年對全群驅蟲2次，晚冬早春（2-3月）采取幼蟲驅蟲技術。阻止“春季高潮”的出現；秋季（8-9月）驅蟲，防止成蟲“秋季高潮”出現和減少幼蟲的“冬季高潮”。對于寄生蟲嚴重的地區，在5-6月可再增加1次驅蟲，避免冬春季發生體表寄生蟲病。2.4 檢疫監測。要定期對結核病、布氏桿菌病進行檢疫監測，至少是1年1次。及時發現陽性羊并進行撲殺處理，這是保障羊群健康和畜產品安全的需要。
3 綜合防疫重在預防
傳染病雖然由傳染源、傳播途徑、方式和易感動物組成，但影響疫病流行的因素卻是多方面的，所以必須采取多方面的綜合防疫措施，消滅一切不利因素，堅持自繁自養的原則，既有利于畜禽的飼養，又可避免購買畜禽時帶進各種傳染病，如需要從外單位引種時，應做到不以疫區購買，但買入后要隔離檢疫１－２日，確認健康無病，方可與原來的動物混飼。從國外引進優良品種時，除加強口岸檢疫外，入場前還應隔離檢疫，發現病畜禽時，應立即嚴格處理。
3.１ 搞好飼養管理，增強個體的抗病能力。加強飼養管理，嚴格遵守原則，不喂發霉變質飼料，不飲污水和冰凍水，使羊膘肥體壯，提高個體的抗病能力。
3.2 搞好環境衛生，圈舍做好消毒工作。圈養羊應保持圈舍、場地和用具的衛生。經常清掃圈舍，對糞便、尿等污物集中堆積發酵３０天左右。同時定期用消毒藥（如：百毒殺、易克林惠昌消毒液等高效低毒藥物）對圈舍場地進行消毒，防止疾病的傳播。
3.3 有計劃地搞好免疫接種工作。對羊群進行免疫接種，是預防和控制羊傳染病的重要措施。使用疫（菌）苗對羊群進行有計劃的預防接種，是提高羊群對相應疫病的抵抗力、預防疫病發生的關鍵。主要應做好羊痘、羊魏氏梭菌病、羊口蹄疫等的免疫接種工作，并及時進行補防。目前預防羊主要傳染病的疫苗有以下幾種：
3.3.1 無毒炭疽芽胞苗。用于預防羊炭疽。綿羊皮下注射０。５毫升，注射后１４天產生堅強免疫力，免疫期一年。（此苗不能用于山羊）
3.3.2 破傷風明礬沉降類霉素。用于預防破傷風。羊頸部皮下注射０。５毫升，１個月后產生免疫力，免疫期１年，第二年再注射１次，免疫期可持續４年。
3.3.3 綿、山羊痘弱毒凍干苗。用于預防綿、山羊痘。按瓶簽上的頭數應用，每頭份用０。５毫升生理鹽水稀釋；每只羊皮內注射０。５毫升（不論大小瘦弱、懷孕均可同量）。注射后５－８天腫脹，硬結，５－１０天逐漸消失。注射后４－６天可產生堅強免疫力，免疫期１年。
3.3.4 羊快疫、猝疽、腸毒血癥（羔羊痢疾）三聯四防苗。用于預防羊快疫、猝疽、腸毒血癥和羔羊痢疾。干粉苗：用２０％鋁膠鹽水溶解不論羊齡大小均皮下或肌肉注射１毫升，１４天產生免疫力，免疫期１年。濕苗（又稱羊四聯苗）：應用前搖勻后每只皮下或肌肉注射５毫升，免疫期６個月。
3.3.5 中Ｏ型口蹄疫滅活疫苗。用于預防羊Ｏ型口蹄疫。肌肉注射：成年羊每只２毫升，羔羊每只１毫升。注射后１５天產生免疫力，免疫期４個月。注射后出現不良反應用腎上腺素救治。3.４ 發生傳染病時應采取措施。羊群發生傳染病后，首先應立即進行隔離、封鎖，逐級上報畜牧獸醫部門，由市、縣級獸醫部門確診，按國家〈動物防疫法〉做無毒化處理；再就是用羊寄生蟲病程序化防治模式進行防治都會有良好的防治效果。