通過科學消毒，切斷傳染病的傳播途徑，就可以預防和防止疾病的感染、發生、蔓延和流行，能夠有效的提高養鴨場生產效益。

1、選擇合適的消毒劑。結合自己鴨舍環境、消毒的目的、對象、疫病流行趨勢及鴨病情況，依據高效、廣譜、經濟、副作用小的原則選擇消毒藥物，并注意嚴格按照消毒藥物的使用說明調配消毒藥物，提高消毒藥的效力，達到消毒的目的。常規消毒用2-3%燒堿溶液、氯制劑、季銨鹽類、碘制劑等噴霧消毒，高錳酸鉀溶液、醛類熏蒸消毒，20%的石灰乳地面消毒。

2、設置消毒池。養鴨場大門前應設置消毒室和消毒池，對出入養鴨場的車輛和人員進行消毒。

3、環境消毒。鴨舍周圍環境要保持清潔干凈，經常用高壓水槍沖洗，地面不能有污水、污物、糞污等。

4、空欄消毒。空欄期要對鴨舍、鴨舍周圍、倉庫、辦公房、用具、設備等進行徹底清掃沖洗并消毒，養上一批鴨用過的衣服鞋子乃至被褥都要清洗消毒，做到不留死角。在進鴨前10天，鴨舍要用福爾馬林加高錳酸鉀密閉熏蒸24小時，然后打開門窗通風。鴨舍周圍2米以內進行除草翻土，鋪墊一層生石灰。

5、帶鴨消毒。消毒前一天給鴨群飲用0.1%維生素C或水溶性多種維生素溶液，以減少應激。消毒時不是往鴨身上噴霧，而是從頂棚、墻壁到地面噴霧消毒，冬天用溫水，夏天用涼水，要選擇刺激性小、高效低毒的消毒劑，不用酸堿類。

6、飲水消毒。在飲水中按比例加入消毒劑(如百毒殺、強力消毒靈、次氯酸鈉等)，每周一次即可，而對雛鴨一般用1‰高錳酸鉀飲水（溫水)即可。

7、鴨糞消毒。每月進行徹底消毒一次，清理運動場上的糞便，將鴨舍內的墊料清理出來，用干燥清潔的墊草代替，鴨糞可用堆積生物熱發酵，并在糞堆表面噴消毒藥液的方法消毒。

8、人員消毒。養鴨場工作人員在進入生產區之前，必須更換消毒過的工作服及膠鞋等，并在紫外線燈下消毒10分鐘左右后，方可進入鴨場，嚴禁外來人員進入養鴨場內。