消毒是指通過物理、化學或生物學的手段殺滅或清除環境中病原體的技術和措施。消毒是傳染病預防措施中的重要內容，它可將養殖場、交通工具和各種被污染物體中病原微生物的數量減少到最低或無害的程度。通過消毒能夠殺滅環境中的病原體，切斷傳播途徑，防止傳染病的傳播和蔓延。
一、日常消毒
進入豬舍的消毒：進入豬舍的人員必須穿膠鞋和工作服，雙腳必須踏入消毒池消毒10秒以上，并更換豬舍內部膠鞋，且洗手消毒。
二、場區內消毒
豬舍外的走道、裝豬臺、生物化尸坑為消毒重點，每周大消毒一次。外界出現重大疫情時，要用生石灰在場周圍建立 2 米寬的隔離帶。
解剖病死豬只后必須用消毒劑消毒現場，尸體進入生物坑、焚燒爐焚燒或無害化處理等，地表用消毒液潑灑，再用生石灰掩蓋，參與人員不得在生產區隨意走動，更換衣服洗澡消毒后方可返回生產崗位。
三、消毒效果檢驗
清洗消毒完成后，要求室內設備表面清潔，無可見顆粒物及污垢，棉拭子采樣細菌檢測，菌落總數小于30CFU/cm2。
動物圈舍地面和墻壁的消毒效果檢驗，一般是通過比較消毒前和消毒后被消毒物品上至少五塊相等面積(1010厘米)中的細菌數，根據細菌數量減少的百分比進行效果的評價。
方法是用滅菌棉拭子蘸取含有中和劑(使消毒藥停止作用)的0.03M磷酸鹽緩沖液，在劃定面積內均勻涂擦采樣后，置于裝有5毫升含中和劑的上述緩沖液中，然后經稀釋定量接種不同的固體培養基進行活菌分類培養計數。
判定指標是細菌總數減少80%以上為消毒效果良好;減少70~80%為較好;減少60~70%為一般;減少60%以下則為不合格。
四、豬舍內部消毒
在平時的飼養管理中，定期對動物圈舍及其空氣、場地、用具或豬群等進行的消毒。如臨產前對產房、產欄和臨產動物體表的消毒，動物斷臍、斷尾或閹割時的術部消毒，醫療器械如體溫表、注射器、針頭等的消毒等。各棟舍內按規定打掃衛生后，每周一、周四帶豬噴霧消毒 2 次。
五、飼料及斷奶仔豬運輸車輛的消毒：
車輛在進場前必須嚴格噴霧消毒2次，要用消毒液將車表面完全打濕：包括車頭、車底、車輪、內外車廂、頂棚等。消毒時間間隔 30 分鐘，消毒后方可從消毒池進入場區。門衛并負責填表做好記錄。種豬運輸車輛必須轉豬專用，具備兩副墊板，并將墊板泡于消毒池中 24 小時后晾干后交替使用。
六、空舍消毒流程：
①豬舍清空后先將燈頭、插座及電機等設備用塑料薄膜包好，整理舍內用具和清理舍內垃圾，用洗衣粉 1:400 對整個豬舍進行噴灑、浸泡，待停放 30 分鐘完全浸泡后用壓力 4MPa 高壓水槍進行清洗。風扇、百葉窗、水簾等地方進行清洗時應將高壓水槍槍頭調成噴霧狀，避免水壓過大損壞設備；
②清洗完畢后馬上打開風扇抽風讓豬舍干燥后，然后用消毒藥對欄舍所有表面進行全面消毒，消毒時間不低于 2 小時；
③消毒后12小時用清水再次沖洗欄舍，再用消毒藥徹底噴霧消毒一次。
④第二次消毒后 12 小時再用清水將欄舍進行沖洗，將欄舍內所有表面打濕，用高錳酸鉀/甲醛熏蒸 2 天。
具體用量：每立方空間需高錳酸鉀 6.25 克，40%甲醛12.5mL;計算：長*寬*高 (包括凹凸部分)。
具體要求方法：先用小噴霧器打濕；使室溫保持在27℃左右；
每10-20米放置一平底容器;先倒入甲醛而后將稱量好的、用紙包的高錳酸鉀放入容器。事先在容器內放入1倍量的水，可使反應緩和，不致使消毒藥濺出來;關閉門窗熏蒸12小時以上，進豬前至少通風24小時。
⑤空欄消毒時間最好控制在 7~10 天，最低不得低于三天。
七、器械消毒流程：
①注射器針頭消毒：注射疫苗前，清洗注射器針頭，高壓滅菌消毒 30分鐘或煮沸消毒45分鐘，晾干備用；
②注射部位消毒：通常用 2~5%碘酊消毒，一次涂抹碘酊不宜過多，盡量等干燥后再注射，否則碘酊進入注射針孔殺滅疫苗而造成疫苗防疫失敗;之后用75%酒精消毒。(即取95%酒精 75mL 加蒸餾水至 95mL)；
③注射用過的針頭先用清水洗干凈，連同清洗后的注射器高壓滅菌 30 分鐘或煮沸消毒45 分鐘，晾干后再使用。
八、常用消毒劑：
豬場常用的消毒劑有衛可、農福、火堿、高錳酸鉀、甲醛、碘酊、酒精和甲紫等，各種消毒劑的使用范圍和濃度差別很大，使用前要參照說明。帶豬消毒的濃度也可用于人的噴霧、洗手等消毒。下面列出常用消毒藥濃度：
九.消毒注意事項：
消毒液的用量：消毒劑必須徹底地將消毒面打濕，消毒的藥液最低使用量為 0.3 L/m2，一般為 0.3~0.5L/m2；
消毒液作用的時間不得低于 30 分鐘；
消毒前要保持消毒對象的清潔衛生；
消毒劑要現配現用，混合均勻，避免邊加水邊消毒現象；
不同性質的消毒液不能混合使用；
甲醛熏蒸消毒時，保持欄舍濕度，消毒時確保欄舍密封性；
定期輪換使用消毒劑；
消毒操作人員做好自身防護措施，避免發生燙傷、灼傷等事故，尤其是使用化學性較強消毒藥，應該做好崗前培訓。
養殖場應將各種消毒工作制度化，明確規定和記錄消毒工作的管理者和執行人，使用消毒劑的種類、濃度和方法，消毒的間隔期限，消毒劑的輪換使用情況以及消毒設施、設備的管理和維護等內容，以便分析總結防制措施的效果。
