水產養殖病害的發生和流行，與養殖對象的生活環境、病原體孳生和生物體自身的抵抗力密切相關。開展水產病害防治，同樣要在改良養殖環境、消滅病原體和增強養殖對象的自身免疫力等方面采取技術措施。
改善養殖環境 進行生態防治
1.改良水質。通過注入清水來稀釋養殖池中的有害代謝物，以改良水質，增強養殖對象的抗病能力；或注入其他水源，以改善生態環境，如注入糞水以促進浮游生物生長。通過清塘，不僅可以除去野雜魚，清除競食生物，而且可以殺滅病原體，有效改良水質。
2.調節溫度。許多病原性寄生蟲最適溫度為20℃左右，通過調節水溫，不僅可以抑制病原體的繁殖，而且可以加速養殖對象的新陳代謝。
3.降低應激反應。如水溫的變動幅度過大、底質嚴重惡化、飼料霉爛變質、突降暴雨、pH值變化、捕撈騷擾、噪音干擾、施藥不當等，都能導致養殖對象產生應激反應。而應激反應則會引起養殖對象的能量消耗使機體的抵抗力下降，為細菌和病毒的感染，甚至暴發疾病創造了機會。
4.進行生態防治。生態防治旨在利用生物之間相互制約的機理來控制病原體，保持養殖環境的平衡，使水產養殖得以正常進行?？稍陴B殖池中加入有益生物，如光合細菌，以促使池中有害物質的轉化；投入吃食性種類，以捕食養殖對象中的病體、弱體。
控制病原體傳播 進行生物防治
1.建立檢疫系統。如引進名、特、優、新品種過程中，引種移植也可成為一條病害傳播渠道。如病毒感染，一般有段潛伏期，只要能建立起高效快速的檢測技術，便可及時發現和進行診斷。
2.進行生態環境控制。養殖水域中，不僅存在大量的致病微生物，而且也有大量的非致病微生物。前者是致病因子，后者的存在往往是保持養殖水域生態平衡的必要條件。而大量的藥物投入，雖然殺滅了致病微生物，但也會使有益于水域生態平衡的非致病的微生物受到抑制。因此，對付水產養殖病毒最有效的手段之一，就是加強對水環境的監測和管理。
3.采用消毒劑控制。用于水產養殖的消毒劑，有氧化劑型和非氧化劑型兩大類，前者(如氧化劑、高錳酸鉀等) 其消殺能力受水溫、pH值、氨氮濃度、懸浮物等因素影響較大，尤其對病毒的滅活能力差；后者 (如硫酸銅、甲醛等)消殺效果差，而且毒性的副作用大，也難有效預防和控制傳染性疾病，特別是病毒病的發生和流行。
4.進行生物防治。如對養殖對象采取混養和間養等方式，可使一部分致病微生物被混養和間養的養殖對象殺滅或吞噬。
應用微生態學原理 進行病害防治
1.微生態學的基本原理。當水生生物處于健康狀態時，在其內外環境中存在一個相對穩定的微生物優勢種群。這一微生物群，既能促進有益菌類的生長，又能抑制有害菌類的繁衍，形成抵御致病菌的第一道防線。在常態下，水生動植物、微生物、生態環境，三者構成一種動態平衡，具有相對的穩定性。
2.慎用抗菌素藥物。濫用抗菌藥，使病原體的耐藥性問題越來越嚴重，施藥量越來越大。如在治療魚病時，應有針對地使用對致病菌有專一性的抗菌藥物，而不應該盲目采用廣譜性的、對非致病菌有殺滅能力的抗菌藥物，以免傷害魚體內的相對平衡的微生物菌群。
3.施用微生物制劑。可以在養殖對象的體內或體表建立起有益微生物的優勢菌群，以達到抑制有害微生物的繁衍，增強養殖對象的抵抗力和免疫力的效果。如目前在水產養殖中廣泛使用的光合細菌(PSB)，不僅可以凈化水質，預防疾病，而且可以促進魚體生長。另一種由腸道厭氧菌等有益微生物制成的制劑，用于魚類腸道微生態系統的重建和調整，對于保持微生態平衡，促進生長發育，均有顯著效果。
消滅敵害生物 保護養殖對象
水產養殖的敵害生物，包括兇猛魚類、水中昆蟲、兩棲類、爬行類和鳥類等。消滅這些敵害生物應分別采取以下技術措施。
1.控制兇猛魚類。常見的兇猛魚類，有烏鯉（鱧）、鱖、鯰、黃顙魚、黃鱔、馬口魚等。控制兇猛魚類的主要手段有：放養魚苗、魚種前，對水域中的兇猛魚類進行清除殺滅；投放養殖苗種前，防止將其他水系的兇猛魚類苗種帶入養殖水域；查明兇猛魚類的繁殖產卵條件，破壞其產卵場所；投放大規格魚種，提高養殖對象抵御兇猛魚類的能力；采用相應的網具釣具，對兇猛魚類進行圍殲。
2.消滅水生昆蟲。常見的害蟲，有紅娘華、水斧蟲、田鱉、水螅、松藻蟲和水蜈蚣、蚌蝦、劍水蚤等。這些害蟲，有的殘殺和捕食魚卵、魚苗，有的大量繁殖，消耗水中的氧氣和養料，使魚苗生長緩慢，甚至引起死亡。對付這些水中害蟲，在放養前全池潑灑生石灰，以消滅其敵害生物。魚苗放養后，則針對具體害蟲、硫酸銅和滅蟲精等，予以殺滅。
3.捕殺危害養殖對象的敵害。主要有水獺、水蛇、水老鼠、蛙類及蝌蚪、水鳥等。這些兩棲類、爬行類以及鳥類等不僅捕食養殖對象，而且是某些寄生蟲的中間宿主和病菌攜帶者，容易造成某些病害的流行。應采取誘捉、獵捕等方式予以驅趕或殺滅。
施用生長物質 提高生理機能
1.施用生長物質。將具有生理調控作用的生長物質施用到養殖對象體內，以提高其生理機能，調節核酸代謝，抑制病源繁殖和擴散，并補充其生長的必需元素。如通過施用生長物質的裙帶菜，在防治腐爛病上效果良好，不僅提高了養殖對象的產量和質量，而且提前了收獲期。其主要機理就是因為通過生長物質的生理調控作用，加強了碳、氮代謝，增加養殖對象的體內核酸及蛋白質含量，促進了生長。
2.應用稀土防治魚病。應用適當濃度的稀土，可以抑制病菌的生長和繁殖，刺激魚的食欲，增強魚的抗逆性，增強魚病防治效果。特別是對草魚的赤皮病、腸炎和爛鰓病等，有明顯的防治效果。
3.研制和采用生物活性物質。生物活性物質是從植物中提煉出來的，其主要功能在于調節生物體內神經傳導和酶系平衡，以促進體內蛋白質合成及其生長發育，提高免疫能力，消除自由基，提高抗突變、抗菌、抗病毒等作用。
進行藥物防治 合理用藥
1.對癥下藥?？茖W選用魚藥，不僅可以防治魚病，而且具有調節新陳代謝、改善消化吸收、促進繁殖生長、提高飼料和肥料效應等功效。對癥下藥，首先要正確診斷。只有診斷對路了，才能進行治療。其次，要查明病因。弄清病原體的來源，切斷病源，改善養殖水域，創造良好的治療環境。再次，科學選藥。選用既要對病體及養殖環境低毒、無害、少殘留，又要成本低，在經濟上合算的良藥。
2.合理施藥。給藥方式一般有以下3種：(1)混水給藥。用水將藥溶解稀釋，進行藥浴或全池潑灑。(2)混餌給藥。在投喂時，一要強調藥餌混合均勻，二是藥物與飼料中添加劑搭配要合理。(3)注射給藥。一般用于免疫注射或親魚催產注射。
3.提高藥效。病原生物的抗藥性問題，已引起了水產養殖界的廣泛重視，解決病蟲害的抗藥性問題，一是輪換用藥，切斷病原體抗藥種群的形成；二是開展藥用增效劑的研制，通過復配，提高藥敢。
改善養殖環境 進行生態防治
1.改良水質。通過注入清水來稀釋養殖池中的有害代謝物，以改良水質，增強養殖對象的抗病能力；或注入其他水源，以改善生態環境，如注入糞水以促進浮游生物生長。通過清塘，不僅可以除去野雜魚，清除競食生物，而且可以殺滅病原體，有效改良水質。
2.調節溫度。許多病原性寄生蟲最適溫度為20℃左右，通過調節水溫，不僅可以抑制病原體的繁殖，而且可以加速養殖對象的新陳代謝。
3.降低應激反應。如水溫的變動幅度過大、底質嚴重惡化、飼料霉爛變質、突降暴雨、pH值變化、捕撈騷擾、噪音干擾、施藥不當等，都能導致養殖對象產生應激反應。而應激反應則會引起養殖對象的能量消耗使機體的抵抗力下降，為細菌和病毒的感染，甚至暴發疾病創造了機會。
4.進行生態防治。生態防治旨在利用生物之間相互制約的機理來控制病原體，保持養殖環境的平衡，使水產養殖得以正常進行?？稍陴B殖池中加入有益生物，如光合細菌，以促使池中有害物質的轉化；投入吃食性種類，以捕食養殖對象中的病體、弱體。
控制病原體傳播 進行生物防治
1.建立檢疫系統。如引進名、特、優、新品種過程中，引種移植也可成為一條病害傳播渠道。如病毒感染，一般有段潛伏期，只要能建立起高效快速的檢測技術，便可及時發現和進行診斷。
2.進行生態環境控制。養殖水域中，不僅存在大量的致病微生物，而且也有大量的非致病微生物。前者是致病因子，后者的存在往往是保持養殖水域生態平衡的必要條件。而大量的藥物投入，雖然殺滅了致病微生物，但也會使有益于水域生態平衡的非致病的微生物受到抑制。因此，對付水產養殖病毒最有效的手段之一，就是加強對水環境的監測和管理。
3.采用消毒劑控制。用于水產養殖的消毒劑，有氧化劑型和非氧化劑型兩大類，前者(如氧化劑、高錳酸鉀等) 其消殺能力受水溫、pH值、氨氮濃度、懸浮物等因素影響較大，尤其對病毒的滅活能力差；后者 (如硫酸銅、甲醛等)消殺效果差，而且毒性的副作用大，也難有效預防和控制傳染性疾病，特別是病毒病的發生和流行。
4.進行生物防治。如對養殖對象采取混養和間養等方式，可使一部分致病微生物被混養和間養的養殖對象殺滅或吞噬。
應用微生態學原理 進行病害防治
1.微生態學的基本原理。當水生生物處于健康狀態時，在其內外環境中存在一個相對穩定的微生物優勢種群。這一微生物群，既能促進有益菌類的生長，又能抑制有害菌類的繁衍，形成抵御致病菌的第一道防線。在常態下，水生動植物、微生物、生態環境，三者構成一種動態平衡，具有相對的穩定性。
2.慎用抗菌素藥物。濫用抗菌藥，使病原體的耐藥性問題越來越嚴重，施藥量越來越大。如在治療魚病時，應有針對地使用對致病菌有專一性的抗菌藥物，而不應該盲目采用廣譜性的、對非致病菌有殺滅能力的抗菌藥物，以免傷害魚體內的相對平衡的微生物菌群。
3.施用微生物制劑。可以在養殖對象的體內或體表建立起有益微生物的優勢菌群，以達到抑制有害微生物的繁衍，增強養殖對象的抵抗力和免疫力的效果。如目前在水產養殖中廣泛使用的光合細菌(PSB)，不僅可以凈化水質，預防疾病，而且可以促進魚體生長。另一種由腸道厭氧菌等有益微生物制成的制劑，用于魚類腸道微生態系統的重建和調整，對于保持微生態平衡，促進生長發育，均有顯著效果。
消滅敵害生物 保護養殖對象
水產養殖的敵害生物，包括兇猛魚類、水中昆蟲、兩棲類、爬行類和鳥類等。消滅這些敵害生物應分別采取以下技術措施。
1.控制兇猛魚類。常見的兇猛魚類，有烏鯉（鱧）、鱖、鯰、黃顙魚、黃鱔、馬口魚等。控制兇猛魚類的主要手段有：放養魚苗、魚種前，對水域中的兇猛魚類進行清除殺滅；投放養殖苗種前，防止將其他水系的兇猛魚類苗種帶入養殖水域；查明兇猛魚類的繁殖產卵條件，破壞其產卵場所；投放大規格魚種，提高養殖對象抵御兇猛魚類的能力；采用相應的網具釣具，對兇猛魚類進行圍殲。
2.消滅水生昆蟲。常見的害蟲，有紅娘華、水斧蟲、田鱉、水螅、松藻蟲和水蜈蚣、蚌蝦、劍水蚤等。這些害蟲，有的殘殺和捕食魚卵、魚苗，有的大量繁殖，消耗水中的氧氣和養料，使魚苗生長緩慢，甚至引起死亡。對付這些水中害蟲，在放養前全池潑灑生石灰，以消滅其敵害生物。魚苗放養后，則針對具體害蟲、硫酸銅和滅蟲精等，予以殺滅。
3.捕殺危害養殖對象的敵害。主要有水獺、水蛇、水老鼠、蛙類及蝌蚪、水鳥等。這些兩棲類、爬行類以及鳥類等不僅捕食養殖對象，而且是某些寄生蟲的中間宿主和病菌攜帶者，容易造成某些病害的流行。應采取誘捉、獵捕等方式予以驅趕或殺滅。
施用生長物質 提高生理機能
1.施用生長物質。將具有生理調控作用的生長物質施用到養殖對象體內，以提高其生理機能，調節核酸代謝，抑制病源繁殖和擴散，并補充其生長的必需元素。如通過施用生長物質的裙帶菜，在防治腐爛病上效果良好，不僅提高了養殖對象的產量和質量，而且提前了收獲期。其主要機理就是因為通過生長物質的生理調控作用，加強了碳、氮代謝，增加養殖對象的體內核酸及蛋白質含量，促進了生長。
2.應用稀土防治魚病。應用適當濃度的稀土，可以抑制病菌的生長和繁殖，刺激魚的食欲，增強魚的抗逆性，增強魚病防治效果。特別是對草魚的赤皮病、腸炎和爛鰓病等，有明顯的防治效果。
3.研制和采用生物活性物質。生物活性物質是從植物中提煉出來的，其主要功能在于調節生物體內神經傳導和酶系平衡，以促進體內蛋白質合成及其生長發育，提高免疫能力，消除自由基，提高抗突變、抗菌、抗病毒等作用。
進行藥物防治 合理用藥
1.對癥下藥?？茖W選用魚藥，不僅可以防治魚病，而且具有調節新陳代謝、改善消化吸收、促進繁殖生長、提高飼料和肥料效應等功效。對癥下藥，首先要正確診斷。只有診斷對路了，才能進行治療。其次，要查明病因。弄清病原體的來源，切斷病源，改善養殖水域，創造良好的治療環境。再次，科學選藥。選用既要對病體及養殖環境低毒、無害、少殘留，又要成本低，在經濟上合算的良藥。
2.合理施藥。給藥方式一般有以下3種：(1)混水給藥。用水將藥溶解稀釋，進行藥浴或全池潑灑。(2)混餌給藥。在投喂時，一要強調藥餌混合均勻，二是藥物與飼料中添加劑搭配要合理。(3)注射給藥。一般用于免疫注射或親魚催產注射。
3.提高藥效。病原生物的抗藥性問題，已引起了水產養殖界的廣泛重視，解決病蟲害的抗藥性問題，一是輪換用藥，切斷病原體抗藥種群的形成；二是開展藥用增效劑的研制，通過復配，提高藥敢。