動物使用疫苗后,同一批疫苗可能在不同地區、不同個體內出現不同反應，表現出不同的癥狀。如減食、精神沉郁、體溫升高或突然死亡等現象。產生這些現象的主要原因是:
　　隱性感染
　　(潛伏期)動物的年齡、體質、品系的不同導致病毒感染后表現的反應不同，潛伏期的長短也不同,因此隱性感染是一個較為復雜的問題,特別是受疫區威脅的動物，在用疫苗前由于檢測水平不到位，難以判斷是否潛伏感染，因此容易出現用苗后的反應現象。
　　過敏反應
　　過敏反應是藥品或疫苗在臨床使用時不可避免的一種現象。由于動物個體差異的原因，相同的藥品或疫苗在不同的動物身上會表現出不同的難以預料的過敏反應。臨床上常見過敏反應以個體為主,但也有成窩出現過敏反應的情況發生，對于此種情況只能以搶救為主,一旦出現立即使用相應的抗過敏藥物,另外接種疫苗后要認真觀察,不要盲目離開。
　　免疫途徑和免疫對象
　　錯誤免疫途徑是根據不同疫苗毒株安全性,作用靶細胞情況而確定的,應根據說明書要求進行注射、滴鼻、點眼、口服或者刺種等,并保證接種時機體的健康狀況良好。
　　多種疫苗同時使用
　　在使用疫苗時大家習慣于多種疫苗同時使用,特別是在使用活疫苗的過程中，多種疫苗同時刺激機體產生抗體之前，容易引發動物產生臨床反應,因此在使用疫苗時不同疫苗的接種時間應盡量間隔3天以上，如果允許盡可能不使用聯苗。
　　動物本身及外界環境的影響
　　生產高峰期及嚴重寄生蟲感染的老、弱、病動物在使用疫苗時容易產生臨床反應。另外外界環境變化、氣溫過冷過熱、長途運輸等應激因素都容易引起臨床反應,在使用疫苗時應避開上述情況。