隨著養豬規模的不斷擴大，疾病的發生率也不斷上升,消毒成了集約化豬場控制與預防疾病發生的重要措施。進行定期消毒目的在于預防病原微生物的入侵、減少死亡率與維護豬群的健康穩定。
       醛類   常用的醛類消毒劑有甲醛與戊二醛。甲醛具有極強的殺菌力，與氧化劑（高錳酸鉀等）結合后所產生的氣體進行熏蒸消毒，是空欄后封閉式消毒的最佳消毒劑。但甲醛刺激性氣味強，對皮膚、黏膜有強烈的刺激作用，多用于浸泡、熏蒸消毒；戊二醛氣味較少，殺菌作用較甲醛強2～10倍，滲透能力強，對任何細菌、病毒、霉菌及頑固的芽胞等都有極強的殺滅作用，但對碳鋼制品有一定的損害，可用于環境及豬體表的消毒，還可用于熏蒸消毒，因其不宜在物體表面聚合，故效果優于甲醛。此類產品如安滅殺（美國先靈葆雅，含有15%的戊二醛）。
       季銨鹽類   季銨鹽類消毒劑是一種離子表面活性劑，屬于合成的有機化合物，有單鏈季銨鹽和雙鏈季銨鹽兩種。單鏈季銨鹽屬陽離子表面活性劑，在陽離子部位具有殺菌能力，無刺鼻味、藥性溫和、安全性高、腐蝕性低，對畜禽傷害低，對細菌病毒殺滅力尚可，但滲透力差，當有機物存在時，效力會大打折扣；雙鏈季銨鹽在陰、陽離子部位均具有殺菌能力，具有單鏈季銨鹽的一系列優點，且殺菌能力較單鏈季銨鹽強，但滲透力差。此類消毒劑可用于帶畜消毒，亦可用于畜禽舍空欄、洗手、用具、運輸車輛、料槽等的消毒。
       鹵素類   含氯制劑即漂白粉、二氧化氯、次氯酸鈉等。該類消毒劑殺菌譜廣，對細菌繁殖體、病毒、真菌孢子及細菌芽胞都有殺滅作用，但揮發性大，有氯氣的臭味，對黏膜有刺激性，一般都不宜久存。可用于飲水消毒，亦可用于畜禽舍、用具、運輸車輛、洗手等的消毒。
       含碘制劑  主要有碘、碘伏等，如市售的有百菌消、碘伏－10等。此類消毒劑殺菌譜廣，對細菌芽胞、病毒、原蟲、霉菌等的殺滅效果佳。對黏膜刺激性小、毒性低，但當有機物存在時效力減弱且容易見光分解。可制成碘酊或碘液對皮膚、傷口消毒，也可用于帶豬消毒，畜舍空欄、洗手、用具、運輸車輛等的消毒。
       石炭酸(酚)類   此類消毒劑屬石油的附屬品，如煤餾油酚(克遼林)、皂化煤餾油酚(來蘇兒)等，有特殊的氣味，滲透力強，價廉，不受有機物的影響，對一般的霉菌、細菌效果尚可，但對病毒、梭菌的芽孢殺滅力不強，且具有腐蝕性和刺激性。一般適用于門口、水泥、磚砌的畜舍空欄、水溝及堆肥場的消毒。
       堿類   常用的有燒堿(94％以上的氫氧化鈉)、生石灰、石灰乳。一般養豬場最常用的是燒堿，因其價廉、穩定性好，能迅速滲入畜禽欄縫及糞尿等有機物中，具有膨脹、起污作用，能達到脫污、清潔兼殺滅細菌、病毒、蟲卵的功用，一般清洗欄舍、飼槽時，可用堿水淋濕浸泡后再沖洗，尚可加在大門口、人、車進出的大水池、畜舍門口的消毒池中。因其腐蝕性強，需空欄使用。
       生石灰也是一種價廉的堿性消毒劑，具有吸濕、除臭、殺菌的功能，多使用在易潮濕的畜舍欄的死角位置，畜舍門口的消毒池或掩埋死尸時覆蓋殺菌等；
       另以一份生石灰，加五份水，配作石灰乳，可用于產房、保育欄的空欄消毒等，有除臭及干涸的效果。需注意的是，市面上銷售建筑用的熟石灰(及消石灰)，無殺毒滅菌的功能。
       過氧化物類   過氧乙酸、過氧化氫與臭氧為國內常見的過氧化物類消毒劑。其中，過氧乙酸的殺菌能力最強，使用最廣泛。該類消毒劑殺菌譜廣，對細菌芽胞、病毒、霉菌等均具殺滅效果，但有刺激性酸味，易揮發，有機物存在可降低其殺菌效果，對畜禽欄舍有一定的腐蝕性。常用于浸泡、噴灑、擦抹、噴霧等的消毒，也可用于空欄消毒。
       其它類  如75％的酒精、碘酒、紅藥水、紫藥水等。可供去勢、剪耳、斷尾及外傷、局部傷口等的殺菌與消毒。