根據年齡和癥狀來判斷 1~2日齡子豬腹瀉，大多由大腸桿菌、低血糖和魏氏梭菌引起；7日齡后的腹瀉，多因傳染性胃腸炎、痢疾、沙門氏菌、輪狀病毒引起；急性、嚴重的水樣腹瀉，由傳染性胃腸炎、流行性腹瀉、偽狂犬病引起；無年齡限制、無明顯時間、一般不太嚴重的腹瀉，多由大腸桿菌、輪狀病毒引起；一窩中少數豬腹瀉，并且是個體最大和最健壯豬腹瀉，大多為梭菌性腸炎引起；一窩中少數豬腹瀉，并且是個體最小和最弱豬腹瀉，大多由低血糖引起。

根據腹瀉程度來判斷 如果是暴發性的、迅速傳播的腹瀉，則為病毒性腹瀉；如果是隱性發生、緩慢散播、隨時間而加重，則為細菌性或寄生蟲性腹瀉。

根據糞便的酸堿度和性狀來判斷 病毒性腹瀉的糞便多為酸性，其他腹瀉的糞便多為堿性。水樣呈噴射狀腹瀉大多為病毒性腹瀉；呈糊狀、帶有泡沫的糞便大多為細菌性腹瀉；呈糊狀、黃灰色、有惡臭的糞便大多為球蟲性腹瀉。

根據糞便中是否帶血來判斷

排黑色煤焦油樣糞便的多為胃潰瘍，可能與粉料太細有關；排鮮紅色糞便的多為血痢和鞭蟲感染。