對腹瀉的治療原則是清查病因、整腸止瀉、調理胃腸、對癥治療。

清查病因 對于細菌性腸道病，篩選合理的抗菌藥物尤為重要，如環丙沙星、卡那霉素、穿心蓮、黃連素等；針對病毒性腸道病，在抗菌消炎的同時，可配伍白頭翁、苦參、博落回、血見愁等清熱解毒、涼血止痢的中藥注射液進行治療；對寄生蟲性腹瀉可合理選用伊維菌素、阿苯達唑等驅蟲藥口服或肌注。對球蟲性腹瀉可選用磺胺類藥、地克珠利或鹽霉素進行治療。

整腸止瀉 當病豬排糞遲緩或者雖排惡臭稀糞而胃腸內仍積滯大量異常內容物時，病初可選用人工鹽、食鹽加適量防腐消毒藥內服，后期則以灌服液體石蠟為好。當病豬腸內積糞已基本排盡，糞的臭味不大時，可選用吸附劑和收斂劑如木炭末、矽碳銀等內服。

調理腸胃 為了恢復胃腸功能，可服用幫助消化的藥物，常用的有胃蛋白酶、乳酶生、酵母、稀鹽酸等。

對癥治療 為緩解病豬脫水和自體中毒，對于有飲欲的病豬可用口服補液鹽讓其自由飲用，對于無飲欲且脫水的病豬可給予葡萄糖生理鹽水、碳酸氫鈉進行靜脈注射，當靜脈注射確實有困難時，可進行腹腔注射，亦可通過胃導管灌服或直腸補給。