一、病原：小腸球蟲、魏氏梭菌、呼腸孤病毒等。
二、病因分析
一傳染性因素：主要是指病毒、細菌、寄生蟲。
1、病毒感染 病毒的感染如呼腸弧病毒、腺病毒、細小病毒、冠狀、輪狀病毒都可以成為腸道腸毒綜合癥發生誘因，這些病毒引起腸道炎癥，損害腸道的吸收功能，感染后肉仔雞典型癥狀發育不良，生長停滯及腹瀉等。
2、細菌感染 常見的一些致病菌，如沙門氏菌、產氣夾膜梭菌、壞死性腸炎魏氏梭菌、大腸桿菌、厭氧菌芽（胞厭氧菌＜梭狀芽胞桿菌屬各菌＞無芽胞厭氧菌引發的禽病）也是引起肉雞腸道腸毒綜合癥的原因，這些菌通過刺激腸道粘膜，使腸蠕動加快加強，消化液排出增多，飼料通過消化道的時間縮短，導致下痢、腹瀉、飼料消化不良。
3、寄生蟲（主要指小腸、盲腸球蟲）的感染 寄生蟲也是引起腸道腸毒綜合癥的重要原因之一，肉雞群在25～40日齡（個別報道15天，最早4～5天發生），這可能跟消毒不嚴格不徹底有關，其誘發病的機理大約為：a、球蟲在腸粘膜上大量生長繁殖，導致腸壁粘膜增厚，嚴重脫落出血等病變，幾乎使飼料不能消化吸收，同時對水分的吸收也明顯減少，盡管肉雞大量飲水，但因吸收不好，也會引起脫水現象。這是引起肉雞糞便變稀、糞中帶有未消化飼料的原因之一；b、球蟲在腸粘膜細胞里快速繁殖、耗氧量大，導致小腸粘膜組織產生大量乳酸，使肉雞腸道PH值嚴重下降，由于腸道PH值的降低，腸道有益菌銳減，有害菌大量繁殖，球蟲與有害菌相互協同、狼狽為奸，導致致病性加強，腸道內容物PH值的下降會使各種消化酶的消化能力下降，飼料消化不良。PH值的下降會刺激腸粘膜，使腸蠕動加快加強，膽囊分泌的膽汁迅速從腸道排出，與未消化的飼料混合在一起，形成綜合征的特征性糞便－－略帶淺黃色的糞便。由于球蟲的有害菌大量快速生長繁殖，導致消化不良、腸道吸收障礙，電解質的吸收減少，使電解質大量丟失，大量的腸粘膜細胞迅速被破壞，出現生理消化障礙，特別是鉀離子的大量消失，會導致心臟的興奮性過度增強，加速本病死亡率。
二非致病性因素
1、各類毒素的影響外來的毒素可能存在于飼料中、飲水中、飼料原料中，如黃曲霉素及其它曲霉素、單寧和自體產生的毒素，如大腸桿菌內毒素、魏氏梭菌毒素等，這些毒素是由于腸上皮細胞被破壞，在腐敗菌及其它有害菌的作用下，發生腐敗分解以及蟲體的死亡、崩解后釋放出大量的有害物質，這些有害物質被機體吸收后發生自體中毒，從而在臨床上出現興奮后昏迷衰竭死亡的情況。
2、飼料中維生素、能量和蛋白質高低對肉雞的影響，飼料中營養越豐富，發病率越高，癥狀也越嚴重，因為大量的能量、蛋白質和部分維生素促進病毒、細菌、寄生蟲的大量繁殖加重癥狀。
3、各類應激因素的影響環境衛生應激因素如溫度高低不穩、飼養密度大、濕度太高太低；飼料應激，如突然更換飼料等，長途運輸、噪音過大、免疫時抓拿等，這些可造成肉雞的生理機能改變，特別是造成胃腸粘膜損傷，粘膜上皮、細胞變性、壞死，從而影響抗體對鈣磷、維生素及其它營養物質的吸收。
三、主要癥狀：
1、初期僅見個別雞糞便變形，變稀，內含沒有消化的飼料。
2、隨后大部分雞開始腹瀉或水瀉，出現該病的典型糞便癥狀：
（1）糞便內含未消化的玉米?；蚨蛊杉R，俗稱料糞。
（2）出現淺紅色或西紅柿樣糞便，易扯絲有彈性.
（3）淺黃綠色稀糞
3、出現以上糞便2---3天后雞群采食量下降，導致增重緩慢或發育不良，雞群消瘦貧血。
4、病雞出現尖叫、瘋跑、跳躍、癱瘓、昏迷等神經癥狀。
5、常與猝死癥并發。
四、主要病變：
1、初期，十二指腸、空腸等小腸壁粘膜增厚，顏色變淺呈灰白色，像一層麩皮，易剝離，腸內容物少或為未消化的飼料。
2、中后期腸壁變薄，粘膜脫落，腸內容物呈蛋清樣、粘膿樣嚴重時腸粘膜完全脫落崩解，腸壁菲薄，內容物呈血膿樣或柿子樣。
3、腸道外觀腫粗，有充盈感，漿膜面有針尖大或小米粒大的黃白色結節。
4、肝、脾有時有細小壞死灶。
5、死亡雞一般發育良好，體肥。
五、防治措施：
一預防措施
1、定期用孤獨球敗或球凈進行球蟲病的預防工作，尤其是小腸球蟲不能麻痹大意。
2、強化消毒意識，加強消毒等管理工作，減少球蟲病的發生。
3、提供科學合理的飼料營養，避免營養缺乏。
4、飼料中長期加入多又大（蛋禽）或速壯1號（肉禽），既可提高飼料轉化率，促進生長，又可改善腸道菌群平衡。
二治療措施
治療原則：殺滅病原，修復破損腸粘膜，補充營養不足。
方案一：腸得樂配合AAA維他命飲水，先計算全天用藥量，集中一次飲水，連用4天；
腸毒清或舒立康拌料，先計算全天用藥量，集中一次飲水，連用4天。
本方案適用于腸毒綜合癥的一般感染。
方案二：腸舒配合AAA維他命飲水，先計算全天用藥量，集中一次飲水，連用4天；
舒立康或清瘟敗毒散拌料，先計算全天用藥量，集中一次飲水，連用4天。
本方案適用于腸毒綜合癥繼發壞死性腸炎的病例。
方案三：漿立清或桿菌必克配合AAA維他命飲水，先計算全天用藥量，集中一次飲水，連用4天；
舒立康或清瘟敗毒散配合九二0（微量元素預混劑）拌料，先計算全天用藥量，集中一次飲水，連用4天。
注意：1、在治療的同時，建議每天用威力精碘和槍手對雞群和環境進行一次消毒。2、本病為惡性疾病、如果不及時治療會造成很大的損失，所以在用藥的同時配合健康伴侶使用可凈化水質、增強藥物的療效達到事半功倍的效果。