感染性腹瀉 細菌性感染：造成子豬腹瀉的細菌性疾病病原主要有大腸桿菌、沙門氏菌、魏氏梭菌等，常引發子豬黃（白）痢、副傷寒、豬痢疾及子豬紅痢等。病毒性感染：豬傳染性胃腸炎、流行性腹瀉、輪狀病毒病等均會造成子豬腹瀉。寄生蟲性感染：在臨床上引起子豬腹瀉的常見寄生蟲有豬球蟲、鞭蟲、蛔蟲、結腸小袋纖毛蟲等。

營養性腹瀉 營養過敏性腹：由于子豬日糧多為玉米—豆粕型飼料，其中有能致子豬過敏反應的抗原物質如大豆球蛋白、半球蛋白等，子豬采食后，易發生超敏反應，引發腹瀉。抗營養因子性腹瀉：因豆粕中含有胰蛋白酶和脲酶，其中前者可與胰蛋白酶結合成不可逆性的復合物，使胰蛋白酶失去分解蛋白質的作用，導致蛋白質進入大腸后未被消化吸收而腐敗發酵引起腹瀉。后者把蛋白質的分解產物水解成氨和二氧化碳，使尿素循環中氨濃度增高，損傷腸道黏膜，引發腹瀉。營養缺乏性腹瀉：豬飼料配比不平衡或豬患慢性消耗性疾病或攝取飼料的量不足等，均可造成豬缺少維生素和礦物質 （鐵、硒、葉酸等），從而導致肌體抵抗力下降，出現下痢。

管理性腹瀉 母豬管理不當：在母豬產前、產后喂給過多植物蛋白而使乳汁中蛋白質含量過多，致使母豬食欲不振，奶水變性或不注重驅蟲工作，致使母豬代謝失調，分泌母乳減少等，均會引發子豬腹瀉。子豬管理不當：如果分娩舍陰暗潮濕，會引發子豬應激性腹瀉，過度限飼及過度飼喂，也會形成饑餓性和過食性腹瀉。

另外，子豬消化道發育不完全，胃酸分泌不足，胃內容物pH值較高，有利于病原菌的生長而不利于消化酶充分發揮作用，從而引發腹瀉。消化酶的分泌過少，可導致乳糖、蛋白質消化不完全，也會誘發腹瀉。同時由于子豬免疫系統、體溫調節系統發育不成熟，抗病力低，而子豬生長發育快，所需營養物質較多，從而使胃腸道消化負擔加重，也易引發腹瀉。