苗飲水量供應不足。供應不足會導致幼雞免疫力的不均衡，計劃用疫苗應與雞每天飲水量的30％左右水量混合。
2.幼雞獲疫苗量不均。如果水槽不是被立即沖滿，那么水槽上游的幼雞會在水流到末端之前消耗大部分疫苗水。因此，傳染病發生常從雞舍后部雞群中開始。應該將一種可與疫苗相溶的染料加進疫苗液，以便在水槽末端能看到水槽何時被充滿，以及何時被關閉。如果供水系統允許的話，要么同時充滿所有的水槽，或一次充滿一排水槽。
3.供水系統的水量不足。在有些情況下，一排或更多排幼雞飲不到疫苗，是由于沒有足夠的疫苗水充滿所有水槽。充滿供水系統所需水量是由水管中所容納的水量決定的［供水系統水量(升)＝水管數×每個水管長(米)×水管內半徑2(厘米)×0.0043］。如果充滿供水系統所需水量少于計劃用的疫苗水量，那么就要增加與疫苗混合的水量，以便使最后一排水槽充滿疫苗水后至少有１小時飲用時間。
4.疫苗被注入污染的水槽。水槽中污染物或有機物對有些病毒疫苗有害。為避免這種危險，建議在免疫前３天往水中加入檸檬酸，前１天再加入脫脂奶粉。
5.使用氯氣消毒水稀釋疫苗。使用含量高于0.5微升／升氯氣的水會導致活病毒苗或細菌失活，免疫前３天關閉氯化器，使用氯氣過濾器或者水在開口容器內放置24小時，使氯氣揮發后再稀釋疫苗，這樣可避免疫苗失活。
