小腸球蟲病在肉雞飼養過程中造成的損害越來越大，其中以毒害艾美耳球蟲的侵害為主。由于毒害艾美耳球蟲的繁殖率低，發病日齡多在8周齡以后，發病雞群表現出明顯體重下降，死亡率升高。

患有雞球蟲腸炎的病雞解剖后可見腸黏膜涂片檢查 從病死雞的小腸中段病變部刮取腸黏膜涂片，用生理鹽水稀釋，加蓋玻片鏡檢，可看到成簇的大型裂殖體。

加強飼養管理和環境衛生，及時清掃雞糞，避免密度過大和通風不良，防止雞糞污染飼料和飲水，保持雞舍干燥清潔，減少細菌污染。

魚粉、小麥或大麥含量高的日糧有誘發壞死性腸炎的傾向，因此建議調整日糧各成分的比例，可以減少雞腸道中的產氣莢膜梭菌，從而降低腸道梭菌病的發病率。

中西藥配合治療球蟲與腸炎，停藥后微生態制劑拌料，調整腸道菌群平衡。