有些活疫苗可以根據是否出現反應來確定免疫效果。

如雞痘疫苗接種后4天，接種部位可出現輕微腫脹，并出現黃色或紅色的結痂，反應持續3天～4天后減輕，14天～21天結痂消失。如沒出現這種反應，應在5天～7天后補種。球蟲疫苗免疫后，個別雞群拉紅色糞便，可自行恢復。傳喉凍干苗涂肛后，肛門黏膜發紅，有炎癥，標志免疫效果良好。

一般來說，疫苗接種途徑的侵蝕性愈強，則疫苗反應就愈強烈，但產生的免疫力也愈強。例如，點眼法的侵害性強于粗粒噴霧，但產生的免疫力也強于粗粒噴霧，而粗粒噴霧的效果又優于飲水免疫。